Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat - Hacettepe Üniversitesi Tıbbi Biyoloji

Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat - Hacettepe Üniversitesi Tıbbi Biyoloji

Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat
Yazışma Adresi
Hacettepe Üni. Tıp Fak. Tıbbi Biyoloji A.D. 06100
Sıhhiye/Ankara
Telefon
0 312 305 25 41
Faks
0 312 309 60 60
e-mail
Uakpulat (@) hacettepe.edu.tr
EĞİTİM DURUMU
2008 - 2014
Doktora (Ph.D.), Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi
Biyoloji Anabilim Dalı, Ankara
2003 - 2006
Yüksek Lisans (M.Sc.), Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi,
Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı / İzmir
1998 – 2003
Lisans, Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü, Temel
ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Ağırlıklı Lisans Programı
AKADEMİK ve ÖZEL SEKTÖR İŞ GEÇMİŞİ
2008 - ...
Hacettepe Üniversitesi Kastamonu Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji
Anabilim Dalı, Araştırma Görevlisi
2005 – 2008
GENTAN / Özel Genetik Tanı Laboratuarı-İzmir, Uzman
2003 – 2006
Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve
Genetik Anabilim Dalı, Proje Asistanı
BİLİMSEL ARAŞTIRMA ALANLARI
Moleküler Hücre Biyolojisi
Kronik iskelet kası dejenerasyonu, İskelet kası gelişimi
moleküler regülasyonu, Satellit hücre biyolojisi
Genetik Hastalıkların Tanısı
(prenatal, postnatal, kanser)
Tek gen hastalıklarının mutasyon analizi, Sitogenetik,
Moleküler sitogenetik
HAZIRLADIĞI TEZLER
Doktora Tezi
Fare Miyoblast Hücre Hattında Klf5 Geninin Farklılaşma Sürecine
Etkilerinin Araştırılması. Danışman öğretim üyesi: Prof. Dr. Çetin
KOCAEFE
Yüksek Lisans Tezi
Maternal Periferik Kandan Fetal Genomik DNA’nın Belirlenmesi.
Danışman öğretim üyesi: Yrd. Doç. Dr. Çiğdem ERESEN
GÖREV ALDIĞI PROJELER
Fare Klf5 Genine Bildirici Etiket Dizisinin Yerleştirilmesi ve Protein Etkileşimlerinin
Belirlenmesi. HÜBAB Projesi, Proje No: 2115, 2014-2016
Klf5 Transkripsiyon Faktörünün Kas Dokusu Farklılaşmasındaki Rolü ve Hedef Genlerinin
Araştırılması. TÜBİTAK_110S364, 2011-2013.
Fare Miyoblast Hücre Hattında Kalıcı ve Uyarılabilir Nitelikte Klf5 Gen İfadesinin
Susturulması. HÜBAB Projesi, Proje No: 5813, 2011-2012
Genetik Kökenli Enzim Eksiklerine Yönelik Enzim Replasmanı Sağlamak Amacıyla Yağ
Hücrelerinin Yeniden Programlanması ve Tedavide Kullanılabilme Potansiyelinin Araştırılması.
TÜBİTAK_107S088, 2007-2010.
Osteoporotik Sıçan Dokularında İskelet Kası Atrofisinin İmmünohistoloji Ve Moleküler
Biyoloji Yöntemleriyle Araştırılması, TÜBİTAK, 2010-2011.
Maternal Periferik Kanda Fetal Genomik DNA’nın Belirlenmesi. KB.SAG.004, 2005-2006,
Dokuz Eylül Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı.
Alkol Bağımlılığında Dopamin 2 Reseptör Geninin ve Kişilik Özelliklerinin Rolü, 2005-2007,
Dokuz Eylül Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı.
ÖDÜLLER
Prof. Dr. Yener AYTEKİN, Türkçe Bilim Dili Özel Ödülü
10. Ulusal Histoloji ve Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010, Çeşme/İZMİR
Fiziksel Egzersizde Endokanabinoidler Bağışıklık Sistemini Düzenlemektedir. Korkusuz P.,
Özdurak H., Zeybek D., Kocaefe Ç., Akpulat U., Kılıç E., Uçkan D., Şeker T., Korkusuz F.
ÜYELİKLER
Tıbbi Biyoloji ve Genetik Derneği
YAYIN LİSTESİ
A. Uluslararası Hakemli Dergilerde Yayınlanan Makaleler
A.1. Ozdemir C, Akpulat U, Sharafi P, Yıldız Y, Onbaşılar I, Kocaefe C. Periostin is temporally
expressed as an extracellular matrix component in skeletal muscle regeneration and
differentiation. Gene. 2014 Dec 15;553(2):130-9. doi: 10.1016/j.gene.2014.10.014.
A.2. Dalmıs A, Akvardar Y, Eresen C, Kızıldag S, Akpulat U, Yıldırımcan S, Arkar H, Akdede
B, Alptekin K. The role of Dopamine 2 receptor gene and personality characteristics in alcohol
dependence in Turkish population. ANATOLIAN JOURNAL OF PSYCHIATRY SEP 2014.
doi:10.5455/apd.44724
A.3. Denizalti M, Bozkurt TE, Akpulat U, Sahin-Erdemli I, Abacıoğlu N. The vasorelaxant
effect of hydrogen sulfide is enhanced in streptozotocin-induced diabetic rats. Naunyn
Schmiedebergs Arch Pharmacol. 2011 May;383(5):509-17. doi: 10.1007/s00210-011-0601-6.
B. Uluslararası Kongrelerde Sunulan Uluslararası Hakemli Dergilerin Özel Sayılarında
Yayınlanmış Bildiriler
B.1. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. Klf5 modulates
proliferation and differentiation of myoblasts. Muscle Res Cell Motil (2014) 35:65–142 DOI
10.1007/s10974-014-9384-y
B.2. Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. SFRP2 designates skeletal muscle fibrosis in
immobilized muscle. Muscle Res Cell Motil (2014) 35:65–142 DOI 10.1007/s10974-014-9384-y
B.3. Gokcen A, Bal F, Akpulat U, Bozkurt K, Aktan E. A consaquineous couple with a
44,XY,der(13;14)der(13;14) and 45,XX,der(13;14) karyotypes and genetic counseling.
Chromosome Research, Springer 2007, DOI: 10.1007/s10577-007-1911-x
B.4. Bal F, Gokcen A¸ Karaman B, Baloğlu A, Cokısılak T, Akpulat U, Basaran S. X/Y
translocation in a family with 4 affected members in 3 generation showing Leri-Weill
dyschondrosteosis phenotype. Chromosome Research, Springer 2007, DOI: 10.1007/s10577007-1911-x
B.5. Kitis A, Akvardar Y, Eresen C, Kizildag S, Akpulat U, Yildirimcan S , Alptekin K,
Akdede B, Arkar H. The role of dopamine 2 receptor gene and personality characteristics in
alcohol dependence in Turkish population.
European Neuropsychopharmacology Volume 16,
Supplement 4, 2006, Pages S491 doi:10.1016/S0924-977X(06)70661-7
C. Uluslararası Bilimsel Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitabında Basılan Bildiriler
C.1. Akpulat U., Yildiz Y., Sharafi P, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. A Novel Role for
Krüppel-Like Factor 5 (KLF5) in the Differentiation and Regeneration of Skeletal Muscle.
EMBO Workshop, Molecular Biology of Muscle Development and Regeneration, May 14 – 18,
2014 Acaya, Lecce, Italy (Poster)
C.2. Akpulat U., Yildiz Y., Sharafi P, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. A Novel Role for
Krüppel-Like Factor 5 (KLF5) in the Differentiation and Regeneration of Skeletal Muscle. 2nd
International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. 22-23 November 2013
Istanbul (Sözlü sunum)
C.3. Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. SFRP2 designates skeletal muscle fibrosis in
immobilized muscle. 42nd European Muscle Conference, 21-25 September 2013, Amsterdam,
Netherlands (Poster).
C.4. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. Klf5 modulates
proliferation and differentiation of myoblasts. 42nd European Muscle Conference, 21-25
September 2013, Amsterdam, Netherlands (Poster).
C.5. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. A novel role for a
ubiquitous zinc finger Klf5 is a modulator of skeletal muscle differentiation and regeneration
regulated by sumoylation. The 4th EMBO Meeting, Nice-France, 22-25 September 2012
(Poster)
C.6. Ozdemir C, Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. Periostin is an extracellular matrix
component expressed in the course of myogenic differentiation and regenerating muscle tissue.
The 4th EMBO Meeting, Nice-France, 22-25 September 2012 (Poster)
C.7. Yildiz Y, Akpulat U, Özdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Uren D, Kocaefe C. Klf5 is an
emerging transcription factor with a role in skeletal muscle regeneration and differentiation.
EMBO Molecular Medicine Conference, Molecular Insights for Innovative Therapies, EMBL
Advanced Training Centre Heidelberg, Germany,01 – 03 December 2011 (Sözlü Sunum)
C.8. Sharafi P, Akpulat U, Özdemir C, Cirak T, Onbasilar I, Kocaefe C. Adipocytes as Novel
Cell Therapy Targets for Inherited Enzyme Deficiencies. EMBO Molecular Medicine
Conference, Molecular Insights for Innovative Therapies, EMBL Advanced Training Centre
Heidelberg, Germany,01 – 03 December 2011 (Poster)
C.9. Sharafi P, Akpulat U, Özdemir C, Cirak T, Onbasilar I, Denktas E, Kocaefe C. Targetting
Adipocytes as a Novel Cell Therapy Approach for Inherited Enzyme Deficiences. International
Conference on Enzyme Science and Technology ,31 October – 04 November, 2011,KusadasıTurkey (Poster)
C.10. Akpulat U, Onbasilar I, Sharafi P, Soylu R, Uren D, Kocaefe C. Utilization of Skeletal
Muscle Immobilization Models for the Discovery of Novel Pathways and Mediatiors of Muscle
Degeneration. Third ICLAS East Mediterranean Meeting, June 13 to 15, 2011, İstanbul-Turkey
(Sözlü Sunum)
C.11. Korkusuz F, Dagdeviren S, Uysal B, Korkusuz P, Zeybek D, Akpulat U, Yildiz Y,
Kocaefe C. Gene expression and immunohistochemical changes in skeletal muscle after
overiectomy and TNF-alpha administration in aged rats. Annual Meeting of the Association of
Bone and Joint Surgeons, June 8 to 12, 2011, Dublin – Ireland (Poster)
C.12. Korkusuz F, Zeybek D., Korkusuz P, Kocaefe C, Akpulat U, Yildiz Y, Kandilci H, Uysal
B, Gumusel B, Dagdeviren S. TNF-alpha Antagonist Recovers Osteoporotic Skeletal Muscle
Function. ORS-Orthopaedic Research Society 2011 Annual Meeting, Long Beach – California
(Poster)
C.13. Dagdeviren S., Zeybek D, Korkusuz P, Akpulat U, Yildiz Y, Kandilci B,Gumusel B,
Korkusuz F. Analysis of Skeletal Muscle in Postmenopausal Osteoporotic Animal Model: The
role of TNF-alpha. IMC17 - International Microscopy Congress, 2010,Rio-Brazil (Poster)
C.14. Zeybek D, Kocaefe C, Akpulat U, Kilic E, Uckan Cetinkaya D, Korkusuz F, Ozdurak
Singin H, Korkusuz P. Endocannabinoids Regulate Immune System During Exercise. IMC17 International Microscopy Congress, 2010, Rio – Brazil (Poster)
C.15. Ozdurak Singin H, Kocaefe C, Korkusuz P, Akpulat U, Korkusuz F. Microarray analysis
in lymphoid tissue following exhaustive endurance exercise. 14th Annual ECSS-Congress,2009,
Oslo- Norway (Poster)
C.16. Akpulat U, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. Endomysial fibrosis in tenotomy
immobilized muscle is coupled with SFRP2 expression from slow-twitch fibers. The EMBO
meeting, 29 August-1 September 2009, Amsterdam – Netherlands (Poster)
D. Ulusal Bilimsel Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitaplarında Basılan Bildiriler
D.1. Akpulat U, Yıldız Y, Sharafi P, Özdemir C, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. Krüppel-like faktör 5
rejenerasyon sürecinde myoblastların proliferasyonu ve farklılaşması için gereklidir. 13’üncü
Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 27-30 Ekim 2013, Kuşadası – Aydın (Sözlü sunum)
D.2. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. İskelet kası deneysel modellerinin kas
dejenerasyonunda yeni mediyatörlerin keşfi için önemi. 13’üncü Tıbbi Biyoloji ve Genetik
Kongresi, 27-30 Ekim 2013, Kuşadası – Aydın (Sözlü sunum)
D.3. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. SFRP2 kronik kas dejenerasyonu sürecinde iskelet kası
fibrozisini kolaylaştırmaktadır. 13’üncü Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 27-30 Ekim 2013,
Kuşadası – Aydın (Poster)
D.4. Dağdeviren S, Zeybek D, Korkusuz P, Kocaefe Ç, Akpulat U, Yıldız Y, Kandilci B, Uysal
B, Gümüşel B, Korkusuz F. Postmenapozal osteoporoti hayvan modelinde iskelet kasının
değerlendirilmesi: TNF-alfa’nın roü. 10’ncu Histoloji Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010,
Çeşme – İzmir (Sözlü sunum)
D.5. Korkusuz P, Sıngın Özdurak H, Zeybek D, Kocaefe Ç, Akpulat U, Kılıç E, Uçkan D,
Şeker T, Korkusuz F. Fiziksel
egzersizde endokannabinoidler bağışıklık sistemini
düzenlemektedir. 10’ncu Histoloji Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010, Çeşme – İzmir
(Sözlü sunum)
D.6. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç.
Kronik kas dejenerasyonu sürecinin microarray
ekspresyon analizi ve fibrozis gelişiminde kas kök hücrelerinin rolü. 11’nci Ulusal Tıbbi
Biyoloji ve Genetik Kongresi, 28 - 31 Ekim 2009, Bodrum – Muğla (Poster)
D.7. Akpulat U, Eresen Ç, Kızıldağ S, Sercan O, Altunyurt S, Güçlü S, Celiloğlu M, Demir N,
Sakızlı M. Maternal periferik kanda fetal genomik DNA’nın belirlenmesi. 10’ncu Ulusal Tıbbi
Biyoloji ve Genetik Kongresi, 6 – 9 Eylül 2007, Antalya (Poster)
D.8. Bal F, Gökçen A, Çokışılak T, Akpulat U. Amniyon Sıvısından Florasan in Situ
Hibridizasyon (FISH) Yöntemi ile Anöploidi Tanısı. 7’nci Ulusal Prenatal Tanı Ve Tıbbi
Genetik Kongresi, Mayıs 2006, Kayseri (Poster)
D.9. Kızıldağ S, Genç Ş,Kılıç Y, Akpulat U, Sercan O, Sakızlı M. Çocukluk çağı akut
lenfoblastik lösemide TEL/AML, BCR/ABL, MLL/AF4 kimerik gen ürünlerinin rt-PCR
yöntemi ile saptanması. 6’ncı Ulusal Prenatal Tanı ve Tıbbi Genetik Kongresi, 21 – 24 Nisan
2004, Belek – Antalya (Poster)