Prof. Dr. Kemal Sami Korkmaz - XXVII. Ulusal Biyokimya Kongresi / 3

ÖZGEÇMİŞ
1.
Adı Soyadı:
Kemal Sami Korkmaz
2.
Doğum Tarihi:
27.04.1964
3.
Unvanı:
Profesör
4.
Öğrenim Durumu:
Derece
5.
Üniversite
Alan
Yıl
Lisans
Biyolojik Bilimler
Orta Doğu Teknik Üniversitesi
1988
Y. Lisans
Tıbbi Bioloji
Dokuz Eylül Üniv. Sağlık Bilimleri Enst.
1992
Doktora
Tıbbi Bioloji
Dokuz Eylül Üniv. Sağlık Bilimleri Enst.
1997
Akademik Unvanlar:
Görev Dönemi
Üniversite
Unvan
Bölüm
Profesör
Profesör
Ege Üniv.
Biyomüh. Bl.
Doçent
Doçent
Ege Üniv.
Biyomüh. Bl.
Yardımcı Doçentlik Tarihi :
-
Researcher
Researcher
Doktora Sonrası
Sidney Kimmel Cancer Center,
Dan Mercola laboratuvarı
araştırmacı
Amerika
Doktora Sonrası
Oslo Biyoteknoloji Merkezi
Fahri Saatçioğlu Laboratuvarı
Dokuz Eylül Üniv.
Tıbbi Biyol.
araştırmacı
Ar. Gör.
6.
Ar. Gör.
Doçentlik Tarihi
:
15 Aralık 2004
Profesörlük Tarihi
:
17 Ocak 2012
Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri
6.1. Yüksek Lisans Tezleri
A. Kıvanç Sezer ;
Prostat kanseri hücre hatlarında apoptoz oluşturulması ve mekanizmasının araştırılması
B. Burcu Erbaykent ;
Prostat kanserinde NKX3.1 transkripsiyon faktörünün DNA hasarı üzerine etki mekanizmasının araştırılması
C. Nuray Böğürcü ;
İzole Edilen ALCAP Moleküllerinin Kanser Hücrelerinde DNA Hasarı ve Onarımına Olan Etkilerinin
İncelenmesi
D. Cansu Alapınar
Enflamatuvar mikroçevre ve Androjen ilişkisi
E. Besra Özmen
Prostat Kanser hücrelerinde çift sarmal kırık onarımının androjen ile değişiminin çalışılması
F. Mert Burak Öztürk
Doğal Ve Yarı Sentetı̇ k Saponı̇ n Grubu Moleküllerı̇ n Antı̇ -İnflamatuvar ve Antı̇ -Kanser Etkı̇ lerı̇ nin
Araştırılması
G. Nurşah Ertunç
Prostat Kanseri Gelişiminde Androjenlerin Oksidatif Stres Kontrolündeki Rolünün Araştırılması
6.2. Doktora Tezleri
A. Canan Sevimli ;
Bazı Alkanna Türlerinin Biyoaktivite Rehberli İzolasyon Yöntemi Kullanılarak
Çeşitli Kanser Hücreleri
Üzerindeki Sitotoksik Etkilerinin in vitro Ortamlarda Taranarak, Hücresel Mekanizmalara ve Apoptoz Yolaklarına Olan Etkilerinin
Araştırılması
B. Hamid Syed Muhammad ; Role of a Homebox Protein HOXB13 in DNA Damage and Repair Mechanisms and as Transcription Factor
C. Bilge Debeleç- Bütüner ;
NKX3.1 Transkripsiyon Faktörünün Hedef Genlerinin ve Prostat Kanseri Gelişimindeki Etkisinin
Araştırılması
D. Lokman Varışlı ;
Hücre Döngüsü kontrolünde HN1’in Rolü
E. Burcu Erbaykent Tepedelen
NKX3.1’in DNA hasarı onarımındaki rolü
Yayınlar
7.
7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities)
1.
Varisli L., Beyoglu G., Roumelioti F.M., Gonen-Korkmaz C., Gagos S., Korkmaz K.S. HN1 knockdown contributes to loss of centrosome
assembly and function via regulating APC/C(Cdh1) during cell cycle progression and division. EMBO Reports, submitted)
2.
The redox biology network in cancer pathophysiology and therapeutics. Manda G, Isvoranu G, Comanescu MV, Manea A, Debelec
Butuner B, Korkmaz KS. Redox Biol. 2015 Jun 25;5:347-357. doi: 10.1016/j.redox.2015.06.014. Review.
3.
Inflammation contributes to NKX3.1 loss and augments DNA damage but does not alter the DNA damage response via increased SIRT1
expression. Debelec-Butuner B, Ertunc N, Korkmaz KS. J Inflamm (Lond). 2015 Feb 15;12:12. doi: 10.1186/s12950-015-0057-4.
eCollection 2015.
4.
Organochlorine pesticides and antioxidant enzymes are inversely correlated with liver enzyme gene expression in Cyprinus carpio.
Karaca M., Varis L., Korkmaz K.S., Ozaydın O, Percin F., Orhan H., Toxicology Letters 230 (2014) 198–207
5.
Debelec-Butuner B., Alapinar C., Gonen-Korkmaz C., Yorukoglu K., Korkmaz KS. Enhanced Akt activity stabilizes -catenin and
facilitates migration of prostate cells via disruption of E-cadherin association upon inflammation. PLoS ONE 9(10): e109868.
doi:10.1371/journal.pone.0109868
6.
Varisli, L., Ozturk B.E., Akyuz G.K., Korkmaz, K. S. HN1 associates with the GSK3β/β-catenin/APC complex, abrogates the E-
cadherin/β-catenin interaction and facilitates the progression of prostate cancer cells. J of Cellular Biochemistry.
7.
Debelec-Butuner, B., Korkmaz, K. S. NKX3.1 contributes to antioxidant response regulation via transactivating GPX2, QSCN6, SOD1
and SOD2. Turkish J. of Biology. Accepted. 2014
8.
Erbaykent-Tepedelen B, Karamil S, Gonen-Korkmaz C, Korkmaz KS. DNA damage response (DDR) via NKX3.1 expression in prostate
cells. J Steroid Biochem Mol Biol. 2014 May;141:26-36.
9.
Mohammed, S., H., Çiçek, S., Karamil, S., Ozturk, M., B., Debelec-Butuner, B., Erbaykent-Tepedelen, B., Varisli, L., Yorukoglu, K.,
Gonen-Korkmaz, C., Korkmaz, K. S., (2013). HOXB13 contributes to G1/S and G2/M checkpoint control by regulating cyclin levels in
prostate. Molecular and Cellular Endocrinology 2014. Mar 5;383(1-2):38-47.
10. Akay S., Ekiz G., Kocabas F., Hames-Kocabas E. E., Korkmaz K. S., Bedir E. A new 5,6-dihydro-2-pyrone derivative from Phomopsis
amygdali, an endophytic fungus isolated from hazelnut (Corylus avellana). Phytochemistry Letters 7 (2014) 93–96
11. Debelec-Butuner B, Alapinar C, Varisli L, Erbaykent-Tepedelen B, Hamid SM, Gonen-Korkmaz C, Korkmaz KS. Inflammation-mediated
abrogation of androgen signaling: An in vitro model of prostate cell inflammation. Molecular Carcinog. 2014 Feb;53(2):85-97
12. Xie L, Korkmaz K, Braun K, Bock J. Early Life Stress-induced Histone Acetylations Correlate with Activation of the Synaptic Plasticity
Genes Arc and Egr1 in the Mouse Hippocampus. J Neurochem. 2013 Feb 16. doi: 10.1111/jnc.12210.
13. Varisli L., Korkmaz C., Mohammed S. H., Bogurcu N., Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Korkmaz K.S., Androgen regulated
HN1 leads proteosomal degradation of androgen receptor (AR) and negatively influences AR mediated transactivation in prostate cells.
Molecular and Cellular Endocrinology 350 (2012) 107 - 117
14. Erbaykent-Tepedelen B., Özmen B., Varisli L., Gonen-Korkmaz C., Debelec-Butuner B., Syed M.H., Yilmazer-Cakmak O., Korkmaz
K.S., NKX3.1 contributes to S phase entry and regulates DNA damage response (DDR) in prostate cancer cell lines. Biochem Biophys Res
Commun. 2011 Sep 12; 414 (1): 123-128
15. Bogurcu N., Sevimli-Gur C., Ozmen B., Bedir E., Korkmaz K.S., ALCAPs induce mitochondrial apoptosis and activate DNA damage
response by generating ROS and inhibiting topoisomerase I enzyme activity in K562 leukemia cell line. Biochem Biophys Res Commun.
2011 Jun 17; 409(4): 738-44.
16. Varisli L., Korkmaz-Gonen C., Tepedelen-Erbaykent B., Debelec-Butuner, Syed Muhammed H., Bogurcu N., Saatcioglu F., Korkmaz
K.S., Ubiqutiously expressed HN1 down-regulates Akt mediated GSK3beta signaling, and its knockdown results with deregulated G2/M
transition in prostate cells. DNA and Cell Biol. 2011 Jun; 30(6):419-29
17. Gur, C., Akgun, I.H., Bedir, E., Korkmaz, K. S., Structure and activity relation in Alkanna. J. Nat. Prod. 2010
18. Azbar, N; Dokgoz, FT; Keskin, T; Eltem R., Korkmaz KS., Gezgin Y., Akbal Z., Oncel S., Dalay MC., Gonen C., Tutuk F., Compara tive
Evaluation of Bio-Hydrogen Production From Cheese Whey Wastewater Under Thermophilic and Mesophilic Anaerobic Conditions.
International Journal of Green Energy, 6 (2): 192-200, 2009
19. Akgun I., Ganzera M., Gur C., Senol S. Korkmaz K.S., Bedir E., Determination of Naphthazarin Derivatives in 16 Alkanna Species by
RP-LC Using UV and MS for Detection. Chromatographia, 70 (5-6): 963-967, 2009
20. Sevimli-Gur C., Korkmaz K.S., Akgun I.H., Bedir E., Chemistry and Biological Activities of Naphthoquinones from Alkanna cappadocica
Boiss. & Bal. Planta Med, 75 (9): 980-980, 2009
21. Sevimli-Gur C., Bedir E., Bickici S., Korkmaz K.S., Biological activities of Turkish Alkanna species. Planta Med., 75 (9): 978-979, 2009
22. Habold C., Gali-Muhtasib H., Korkmaz K.S., Hartig R., Roessner A., Schneider-Stock R. Acetylation-dependent upregulation of p21WAF1
expression after H2O2-associated DNA-damage in colorectal cancer cells. J Cell Mol Med. 2008 Mar-Apr; 12(2): 607-21.
23. Pekin, G., Ganzera, M., Senol, S., Bedir, E., Korkmaz, K. S., Stuppner, H. Determination of naphthazarin derivatives in endemic Turkish
Alkanna species by reversed phase high performance liquid chromatography. Planta Med. 73(3): 267-72, 2007
24. Korkmaz C.G., Korkmaz K.S., Kurys P., Elbi C., Klokk T.I., Hammarstrom C., Svindland A., Hager G.L., and Saatcioglu F. Molecular
cloning and characterization of STAMP2, an androgen regulated six-trans-membrane protein that is overexpressed in a subset of prostate
cancers. Oncogene. Jul 21;24(31):4934-45, 2005
25. Hayakawa J., Mittal S., Wang Y., Korkmaz K.S., Adamson E., English C., Omichi M., McClelland M., Mercola D. Identification of
promoters bound by c-Jun/ATF2 during rapid large-scale gene activation by genotoxic stress. Molecular Cell., 16 (Nov 19): 1-20, 2004
26. Korkmaz C.G., Korkmaz K.S., Manola J., Xi Z., Risberg B., Danielsen H., Kung J., Sellers W.R., Loda M., Saatcioglu F. Analysis of
androgen regulated homeobox gene NKX3.1 during prostate carcinogenesis. J Urology, 172(3):1134-9, 2004
27. Xi Z., Klokk T. I., Korkmaz K.S., Kurys P., Elbi C., Risberg B., Danielsen H., Loda M., Saatcioglu F. Kallikrein 4 Is A Nuclear Protein That
Is Over-Expressed In Prostate Cancer. Cancer Research, 64(7):2365-70, 2004
28. Adamson E., de Bell I., Mittal S., Wang Y., Hayakawa J., Korkmaz K., OHagan D., McClelland M., Mercola D. Egr1 signaling in p rostate
cancer. Cancer Biology & Therapy, 2(6):617-622, 2004
29. Skotheim, R.I., Korkmaz, K.S. Klokk, T. I., Abeler, V. M., Korkmaz, C. G., Nesland, J. M., Fossa, S. D., Lothe, R. A., Saatcioglu, F.
NKX3.1 Expression Is Lost in Testicular Germ Cell Tumors. American J Pathology, 163: 2149-2154, 2003
30. Korkmaz K.S., Elbi C. C., Korkmaz C. G., Loda M., Hager G.L., Saatcioglu F. Molecular cloning and characterization of STAMP1, a
highly prostate specific six-trans-membrane protein that is overexpressed in prostate cancer. J. Biological Chemisty 277(39): 3668936696, 2002
31. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 compared
with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple hormones." DNA and
Cell Biol., 20(7):435-445, 2001
32. Matsuda T., Junicho A., Yamamoto T., Kishi H., Korkmaz K., Saatcioglu F., Fuse H., and Muraguchi A. Cross-talk between Signal
Transducer and Activator of Transcription 3 and Androgen Receptor signaling in Prostate Carcinoma Cells. Biochem. Biophys. Res. Com.,
283:179-187, 2001
33. Junicho A., Matsuda T., Yamamoto T., Kishi H., Korkmaz K., Saatcioglu F., Fuse H., and Muraguchi A. Protein inhibitor of activated
STAT3 regulates androgen receptor signaling in prostate carcinoma cells. Biochem. Biophys. Res. Com., 278(1):9-13, 2000
34. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Ragnhildstveit E., Kizildag S., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Full-length cDNA sequence and genomic
organization of human NKX3A - Alternative forms and regulation by both androgens and estrogens." Gene 260(1): 25-36, 2000
35. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Ragnhildstveit E., Saatcioglu F., "An efficient Procedure for Cloning Hormone Responsive Genes from a
Specific Tissue." DNA and Cell. Biol. 19(8): 499-506, 2000.
36. Guran S., Bahce M., Beyan C., Korkmaz K.S., Yalcin A. " p53, p15 INK4B, p16INK4A, and p57KIP2 mutations during the progression of chronic
myeloid leukemia" Heamatologia, 29(3): 181-183, 1998
37. Sercan H.O., Korkmaz K.S., Yazıcioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A." Two Brothers with a 7.0 KB Gene Deletion Associated with
Isolated Growth Hormone Deficiency type 1A" J Pediatr Endocrinol Metab., 9 (3): 423-7, 1996.
38. Cingöz S., Yörükoğlu K., Atabey N., Korkmaz K. S., Özen E., Sakızlı M., " DNA Isolation of DNA for Polymerase Chain Reaction From
Formalin-fixed and Paraffin-embedded Tissues", Turkish Journal of Medical Sciences, 24 (4): 259-262, 1995.
39. Korkmaz K.S., Sercan H.O., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A." A case with 6.7 KB Gene Deletion Associated with Isolated
Growth Hormone Deficiency type 1A.", Turkish Journal of Paediatrics, Jan-March 39: 99-104, 1997.
40. Çelik Ş., Korkmaz K.S., Sarıoğlu S., Küpelioğlu A., Sakızlı M., " Detecting p53 exon 7 mutations of Colorectal carcinomas by Restriction
Enzyme Analysis " Turkish Journal of Cancer, 28(4): 174-8, 1998
41. Sarıoğlu S., Pabuççuoğlu U., Korkmaz K.S., Bilkay İ., Akman F., Kuyucuoglu F., Baskın H., Güneri A.,“ Epstein-Barr virus infection and
nasopharyngeal carcinoma” Turkish Journal of Cancer, 27(1):5-12, 1997
42. Tezel A., Korkmaz K.S., Çelik Ş., Sarıoğlu S., Özer E., Atabey A., Sakızlı M., “Microsatellite Instability in Malign Melanoma and
Melanocytic Nevi.” Kanser Gündemi, 2/3 July 1997.
7.2. Uluslararası diğer hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
7.3. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler
1. Lokman Varisli, Ceren Gonen-Korkmaz, Hamid Syed Muhammed, Bilge Debelec-Butuner, Burcu Erbaykent-Tepedelen, Kemal Sami
Korkmaz. Androgen regulated HN1 leads proteosomal degradation of Androgen Receptor and negatively influences AR med iated
transactivation in prostate cells. Growth and Proliferation: Molecular Regulators of Cancer. Sept 5-8, 2011, Oslo. Norway
2. Varisli L., and Korkmaz K.S. " HN1 is a novel EGF regulated gene that is involved in AKT mediated GSK3 consquently B -catenin
signaling" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, 2011, Istanbul-Turkey.
3. Varisli L., and Korkmaz K.S. " HN1 is an androgen regulated gene, negatively regulates androgen receptor signaling in prostate
cancer cells" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, 2011. Istanbul-Turkey.
4. Hamid, M. S., Varisli, L., Erbaykent, T. B., Debelec, B. B., and Korkmaz, K.S. ''Hoxb13 associates with cell cycle regulators, arrests
cells at G1/S transition and its knockdown drives prostate cancer cells''. 4th. International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe
University, Istanbul, Turkey. 2011.
5. Debelec-Butuner B., Alapinar C., Erbaykent-Tepedelen B., Muhammed H.S., Varisli L., Korkmaz K.S., “Loss of NKX3.1induced by
inflammatory cytokines in prostate cancer development”, The COST Action BM0703 – Cancer and Control of Genomic Integrity, 3rd
Genomic Instability Workshop, Milano, Italy. 2010.
6. Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Muhammed H.S., Varisli L., Bogurcu N., Korkmaz K.S., “An Inflammation Model for
Studying NKX3.1 Tumor Suppressor Function in LNCaP Cells”, International Postgraduate Student Meeting on Pharmaceutical
Sciences, Cesme Turkey. June 24-27 2010, Oral Presentation.
7. Debelec-Butuner B., Varisli L., Korkmaz K.S., “Identification of transcriptional targets of NKX3.1”, 9th International Symposium on
Pharmaceutical Sciences (ISOPS-9), Ankara, Turkey. 2009.
8. Debelec-Butuner B., Korkmaz K.S., “Recombinant protein production of prostate tissue spesific NKX3.1 and STAMP1 proteins” 9th
International Symposium on Pharmaceutical Sciences (ISOPS-9) Ankara, Turkey. 2009
9. Hamid, M. S., Erbaykent, T. B., Debelec, B. B., Varisli, L., Bogurcu, N. and Korkmaz, K.S. ''Functional characterization of HOXB13
targets in prostate''. High-throughput screens in genome integrity and cancer. Gray Institute for Radiation Oncology and Biology,
Oxford University, Oxford, UK. 2009.
10. Varisli L., Erbaykent-Tepedelen B., Bogurcu N., Muhammed H.S., Debelec-Butuner B., Sevimli-Gur C., Korkmaz K.S., “HN1: An EGF
Responsive Gene Regulates Cell Cycle in Prostate Cancer” 2nd Annual Meeting on Cancer and Control of Genomic Integrity,
Stockholm-Sweden. 2009.
11. Erbaykent-Tepedelen B., Debelec-Butuner B., Varisli L, Muhammed S.H., Bogurcu N., Gonen-Korkmaz C., Korkmaz K.S. “NKX3.1
abrogates DDR and promotes growth arrest in prostate cell lines” 2nd GENICA/CANGENIN Genomic Instability Workshop, Athens,
Greece. 16-19 May 2009, poster presentation.
12. Erbaykent-Tepedelen B., Butuner B.D., Varisli L., Sevimli C., Muhammed H.S., Bogurcu N., Korkmaz, K.S. “Ectopic expression of
NKX3.1 blocks DNA damage related H2AX phosphorylation and promotes growth arrest in prostate cancer cell lines” IV. International
Bioengineering Congress, Izmir, Turkey. Oct 15-18 2008, poster presentation.
13. Erbaykent-Tepedelen B., Gonen-Korkmaz C., and Korkmaz K.S., “Ectopic expression of NKX3.1, restores DNA damage related
H2AX phosphorylation and promote senescence in prostate cancer cell lines” EYSF (European Young Scientist Forum), 2008
14. Varisli L., and Korkmaz K.S. “HN1 is an EGF Responsive Gene and Involved in Cell Cycle Regulation” II. Multidisipliner Kanser
Araştırma Sempozyumu, Uludağ, Bursa. 24-27 Şubat 2008.
15. Sevimli C., Şenol S., Akgun I., Caliskan O.A., Bedir E., Korkmaz K.S., Cytotoxic and DNA Damage Effect of Topoisomerase Inhibitors
Isolated From Endemic Alkanna Species on Cancer Cells. Multidisiplinary Cancer Symposium 2008. Bursa-Uludag, TURKEY
16. Erbaykent-Tepedelen B., Butuner B.D., Korkmaz K.S. “Is NKX3.1 a balancing factor between cell survival and apoptosis?” Molecular
Biomimetics & Bionanotechnology-II International Workshop, Istanbul Technical University (ITU-MOBGAM), Istanbul, Turkey, May
23-25, 2007, poster presentation.
17. Varisli L., and Korkmaz K.S. “In silico investigation of differentially expressed genes in androgen treated LNCaP cells” Mole cular
Biomimetics&Bionano Technology II. Dr. Orhan Ocalgiray Molecular Biology-Biotechnology&Genetics Research Center MOBGAM
ITU, İstanbul/Turkey. 23-25 may 2007
18. Sevimli C., Bıçkıcı S., Nalbantoglu S., Şenol S., Gürhan I.D., Korkmaz K.S., Bedir E., Topoisomerase Inhibitors, Cytotoxic Activity of
the Roots and Aerial Parts of Alkanna in Various Human Cancer Cell Lines. FEBS Meeting, 2006 İstanbul
19. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Hayakawa J., Mittal S., Wang Y., Adamson E., Mcclelland M., Mercola D. Profiling of androgen
receptor regulatory transcriptional complexes in prostate cancer. 96 nd American Association for Cancer Research, Anaheim, USA,
2005
20. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1
compared with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple
hormones." 3rd Nuclear Receptors Meeting, Oslo, NORWAY, 2001.
21. Korkmaz K.S., Sercan H.O., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A."Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated
with 7.0 KB Gene Deletion" 16th International Symposium on Growth and Growth Disorders, Lisbon, PORTUGAL. 1993.
22. Sercan H.O., Korkmaz K.S., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A."Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated
with 7.0 KB Gene Deletion" 21st Congress of Union of Middle Eastern and Mediterranean Paediatric Societies, Izmir, TURKEY. 1993.
7.4. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler
1. Kemal KORKMAZ, Ceren Gönen KORKMAZ “Kanserde DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” MEME KANSERİNE MOLEKÜLER VE
GENETİK YAKLAŞIM, Bölüm 1: Genel Kanser Biyolojisi, Ege Üniversitesi yayınları. ISBN: 978-975-483-928-9, 2011
2. Kemal KORKMAZ “DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” Dokuz Eylül Üniversitesi yayınları, Hücre Ölümü Araştırma derneği yayınları
I., 2011
7.5. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
1. Çelik Ş., Korkmaz K.S., Sarıoğlu S., Küpelioğlu A., Sakızlı M., " Detecting p53 exon 7 mutations of Colorectal carcinomas by Restriction
Enzyme Analysis " Turkish Journal of Cancer, 28(4): 174-8, 1998
2. Tezel A., Korkmaz K.S., Çelik Ş., Sarıoğlu S., Özer E., Atabey A., Sakızlı M., “Microsatellite Instability in Malign Melanoma and
Melanocytic Nevi.” Kanser Gündemi, 2/3 July 1997.
3. Sarıoğlu S., Pabuççuoğlu U., Korkmaz K.S., Bilkay İ., Akman F., Kuyucuoglu F., Baskın H., Güneri A.,“ Epstein-Barr virus infection and
nasopharyngeal carcinoma” Turkish Journal of Cancer, 27(1):5-12, 1997
7.6. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler
7.7. Diğer yayınlar
KORKMAZ K.S. “Gene Technologies And Its Applications” May 1-5, 2000, EBILTEM, IZMIR, TURKEY.
7.8. Uluslararası atıflar
26.04.2014 tarihinde >850 atıf (WEB of Science)
8. Ulusal & Uluslararası Projeler
105S101 TÜBİTAK- SBAG
Genotoksik antikanser ekstrelerin elde edilmesi, hücresel mekanizmalara ve apoptoz yolaklarına
olan etkilerinin araştırılması
106S200 TÜBİTAK- SBAG
NKX3.1 Transkripsiyon Faktörünün Tümör Baskılayıcı Yeteneğinin Önemi Ve Prostat Kanserinde
Hedef Genlerinin Araştırılması
108S288 TÜBİTAK-
Prostat ve meme kanserinde DNA hasarına karşı gelişen dirençliliğin (fosforilasyon aracılıklı
SBAG, COST 0708
mekanizmalarının) araştırılması
109T966 TÜBİTAK- TBAG
NKX3.1 ve HOXB13 ‘ün rekombinant proteinlerinin üretilmesi
108Y474 TÜBİTAK-
Büyük Menderes Sucul Ortamında Kalıcı Organik Kirletici ve Endokrin Bozucu Bileşiklerin Neden
ÇAYDAG
Olduğu Çevresel Kirlenmenin Analizi, Biyogöstergeler Aracılığıyla izlenmesi ve Toksik Etkilerinin
Belirlenmesi
110S134 TÜBİTAK- SBAG
Prostat ve meme kanserinde HN1’in hücre döngüsü kontrolündeki rolü
210T066 TÜBİTAK İKİLİ
Hayvan depresyon modelinde Histonlardaki Epigenetik değişikliklerin rolü: erken stress deneyimi
İŞBİRLİĞİ – BMBF
sonrası oluşan kromatin yeniden yapılanması
(Almanya)
Ege Universitesi – BAP
Genotoksik antikanser ekstrelerin elde edilmesi, hücresel mekanizmalara ve apoptoz yolaklarına
olan etkilerinin araştırılması
(CBBS) Center for
Chromatin Remodelling related to stress- and learning-induced neuronal plasticity during early
Behavioral and Brain
development
Sciences
Dr. Joerg Bock, Otto von Guericke Magdeburg Univ. Doğa Bilimleri Fakültesi, Nörobiyoloji Bl.
DFG/SBF 779
Influence of juvenile training on learning efficiency in adult animals
Prof. Anna Katharina Braun, Otto von Guericke Magdeburg Univ. Doğa Bilimleri Fakültesi,
Nörobiyoloji Bl.
TÜBİTAK- 113S044 COST
Oksidatif DNA hasarı aracılıklı prostat kanseri gelişimine androjenlerin etkisinin araştırılması
1203
TÜBİTAK- 113Z083
Siklin kompleksleri ve mitotik iğ ipliği oluşumları ile, HN1 aracılıklı hücre döngüsü kontrolünün
çalışılması.
9.
İdari Görevler
Ege Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, BAP komisyonu üyeliği
Tübitak – KBAG Yürütme Kurulu (Danışma) Üyeliği
10. Bilimsel ve Mesleki Kuruluşlara Üyelikler
“Moleküler Kanser Araştırma Derneği”, MOKAD üyeliği
“European Association for Cancer Research” derneği üyeliği
“Hücre Ölümü Araştırma Derneği”, HÖAD yönetim kurulu üyesi, kurucu üyeliği ve başkan yardımcılığı.
11. Ödüller (Burslar)
Tübitak NATO B2 Bursu (6 ay)
Norveç Ulusal Kanser Enstitüsü Bursu ( 4 yıl)
Amerikan Ulusal Kanser Enstitüsü, NCI (Amerika) post doc bursu (2 yıl)
12. Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler için aşağıdaki tabloyu doldurunuz.
Akademik
Yıl
Dönem
Haftalık Saati
Dersin Adı
Teorik
Güz
Öğrenci
Sayısı
Uygulama
Biyoinformatik I 7. yyıl
2
Uygulamalı Biyoinformatik YL
2
Moleküler Biyoloji 4. yyıl
3
30
Modern Biyoloji 4. yyıl
3
132
12
2
7
2010-2011
Bahar
Güz
Biyoinformatik I 7. yyıl
2
12
Genel Biyoloji I
5 (4 hafta)
50
Kanser Moleküler Biyolojisi
2
7
Moleküler Biyoloji 4. yyıl
3
Mol. Biolojide Özel Konular
2
Modern Biyoloji 4. yyıl
3
2011-2012
Bahar

Biyoinformatik. (8. yarı yıl. Biyomühendislik Bölümü, Lisans programı, seçmeli ders)

Uygulamalı Biyoinformatik (Fen Bilimleri Enstitüsü YL programı seçmeli ders)

Moleküler Biyolojide Özel Konular (Fen Bilimleri Enstitüsü YL programı seçmeli ders)

Biyoteknolojiye Giriş (8. yarı yıl. Kimya Bölümü, Lisans programı, seçmeli ders)

Kanser Moleküler Biyolojisi (Fen Bilimleri Enstitüsü Doktora programı seçmeli ders)

Kanser Biyolojisi (Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Temel Onkoloji YL ve Doktora programı Zorunlu ders)

Modern Biyoloji (4. yarı yıl. Bilgisayar Bölümü, Lisans programı, Zorunlu ders)

Moleküler Biyoloji (8. yarı yıl. Biyomühendislik Bölümü, Lisans programı, zorunlu ders)
Bilimsel Toplantının Adı
Yeri
Tarihi
UL
UA
K
Y
D
B
4. Uluslararası Biyomühendislik Kongresi
İzmir
2010


120


5. Uluslararası Biyomühendislik Kongresi
İzmir
2012


140


1. Hücre ölümü araştırma Derneği Teorik
İzmir
Kasım 2011



190

Kursu
Eskişehir
Mart 2013

Çeşme- İzmir
Kasım 2013

2237 Proje eğitimi kursu
Gaziantep
Ekim 2014
35
3. Hücre ölümü araştırma Derneği Kursu
Gaziantep
Ekim 2014
20
3. Hücre ölümü araştırma Derneği Pratik
Celal Bayar
Haz. 2015
16
Kursu
Üniv. Manisa
2. Hücre ölümü araştırma Derneği Teorik
170



155



Kursu
1. Uluslararası Katılımlı Hücre ölümü

araştırma Derneği Kongresi
