Doç.Dr. Ahmet İpek - Bahçe Bitkileri Bölümü

Doç. Dr. Ahmet İPEK
Telefon
:+90 224 2941484
Faks
:+90 224 4429098
E-posta
: [email protected]
Adres
: Uludağ Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü
Nilüfer 16059 Bursa
Yabancı Dil
: İngilizce
Uzmanlık Alanları : Bahçe Bitkileri Biyoteknolojisi,
Sebze yetiştirme ve Islahı
ÖĞRENİM DURUMU
Derece
Lisans
Y. Lisans
Doktora
Bölüm/Program
Bahçe Bitkileri
Bahçe Bitkileri
Bahçe Bitkileri
Üniversite
Çukurova Üniversitesi
University of Wisconsin-Madison,
ABD
University of Wisconsin-Madison,
ABD
Yıl
1991
1997
2002
GÖREVLER
Görev Unvanı
Dr.Araş.Gör.
Dr.Öğr.Gör.
Yrd.Doç.Dr.
Doç.Dr.
Görev Yeri
Yıl
Ziraat Fakültesi, Uludağ Üniversitesi
Ziraat Fakültesi, Uludağ Üniversitesi
Ziraat Fakültesi, Uludağ Üniversitesi
Ziraat Fakültesi, Uludağ Üniversitesi
2002
2005
2007
2012
Page 1 of 8
Yüksek Lisans Tez Konusu : Transformation of Activator (Ac) and Dissociation
(Ds), Maize Transposable Elements, into the Genome of Carrot (Daucus carota
L.).
Doktora Tez Konusu : Introduction of an Ac/Ds Based Two-Element Transposon
Tagging System and Trans-Activation of Ds in Carrot (Daucus carota L.).
PROJELERDE YAPTIĞI GÖREVLER
1. “Havuç Bitkisinde Sitoplazmik Genetik Erkek Kısırlığı Kontrol Eden Hücre
Çekirdeğinde Yer Alan Genlerin Genetik Haritasının AFLP Markırları
Kullanılarak Belirlenmesi”, TÜBİTAK (Proje No: TOVAG-111 O 119), Proje
Yürütücüsü, 2011- .
2. “Moleküler markırlar kullanılarak önemli bazı standart zeytin çeşit ve
melezlerinin DNA profillerinin belirlenmesi ve gen haritasının çıkarılması”,
TÜBİTAK (Proje No: TOVAG–105 O 071), Proje Yürütücüsü, 2005-2008.
3. “Sarımsakta (Allium sativum L.) Gen İfade Profili (mRNA) Analizi ve
Çiçeklenmeyi Kontrol Eden Aday Genlerin Belirlenmesi”, TÜBİTAK (Proje No:
TOVAG-105 O 551), Yardımcı Araştırıcı, 2007-2011.
4. “Yüksek Sıcaklık Stresinin Çilek Bitkisinde Antioksidant, Karbonhidrat ve
Protein Metabolizmasına Etkileri”, TÜBİTAK (Proje No: TOVAG-108 O 063),
Yardımcı Araştırıcı, 2008- .
5. “Zeytinde Periyodisiteyi Kontrol Eden Genlerin Tespiti ve Karakterizasyonu”,
TÜBİTAK (Proje No: TOVAG-110 O 108), Danışman, 2010- .
6. “Bazı Üzümsü Meyve Türlerine Ait Çeşitlerin DNA Parmak İzlerinin AFLP ve
SSR Moleküler Markırları Kullanılarak Belirlenmesi”, Uludağ Üniversitesi
Bilimsel Araştırmalar Komisyonu (Proje No: Z-2006/57), Proje Yürütücüsü,
2006-2009.
7. “Yerli ve yabancı bazı kiraz çeşitlerinin AFLP ve SSR moleküler markırları
kullanılarak tanımlanması”, Uludağ Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar
Komisyonu (Proje No: Z-2006/36), Yardımcı Araştırıcı, 2006-2010.
8. “Gemlik Zeytin Çeşidinin Periyodisiteye Bağlı Olarak Çiçek Morfolojisi ve
Sitolojisinin Araştırılması”, Uludağ Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar
Komisyonu (Proje No:Z-2007/9), Yardımcı Araştırıcı, 2007- .
9. “Gemlik Zeytin Çeşidinde Periyodisite Üzerine Etkili Olan Önemli Fenolik
Bileşiklerin Araştırılması”, Uludağ Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar
Komisyonu (Proje No:Z-2008/22), Yardımcı Araştırıcı, 200810. “Sarımsak Genomu İçin SSR (Basit Dizi Tekrarları) Markırlarının
Geliştirilmesi”, Uludağ Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Komisyonu, (Proje
No:UAP(Z)-2010/50), Yardımcı Araştırıcı, 201011. “Türkiye’nin Önemli Zeytin Yetiştiriciliği Yapılan Bölgelerindeki Zeytin
Çeşitlerinin DNA Parmak İzlerinin Moleküler Markırlar Kullanılarak
Belirlenmesi” Marmarabirlik Zeytin Tarım Satış Kooperatifleri Birliği, Yardımcı
Araştırıcı, 2007-2010.
Page 2 of 8
İDARİ GÖREVLER
1. Lisans öğrencilerine danışmanlık, Uludağ Üniversitesi, Ziraat Fakültesi 20062011.
2. Proje danışmanı, Proje Yönetim Merkezi, Uludağ Üniversitesi 2009-2011.
3. Satın alma komisyonu üyeliği, Uludağ Üniversitesi, Ziraat Fakültesi 2008- .
BİLİMSEL KURULUŞLARA ÜYELİKLER
1.
2.
3.
4.
Bahçe Bitkileri Derneği
Biyoteknoloji Derneği
International Society for Horticultural Sciences (ISHS)
American Society for Horticultural Sciences (ASHS)
ÖDÜLLER
1. T.C. Milli Eğitim Bakanlığı’ndan 1416 sayılı kanuna göre yurtdışında yüksek
lisans ve doktora öğrenimi bursu, 1994.
2. University of Wisconsin, Madison, ABD, Vilas Travel Grant Award Graduate
School ödülü, 2001.
3. TÜBİTAK Bilimsel Yayınları Teşvik Ödülü, 2005-2009.
4. Amerika Birleşik Devletleri Tarım Bakanlığı doktora sonrası araştırma bursu,
2002.
5. Amerika Birleşik Devletleri Tarım Bakanlığı doktora sonrası araştırma bursu,
2006.
6. Amerika Birleşik Devletleri Tarım Bakanlığı doktora sonrası araştırma bursu,
2010.
VERDİĞİ DERSLER
Lisans Dersleri
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Genel Sebzecilik
Bahçe Bitkileri Islahı
Özel Sebzecilik-1
Sebze Tohumculuğu
Bahçe Bitkileri Biyoteknolojisi
Özel Sebzecilik-2
Lisans Üstü Dersleri
1. Bahçe Bitkilerinde Moleküler Biyoloji Teknikleri
Page 3 of 8
ESERLER
Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler
M.İpek, A.İpek ve P.W.Simon, "Comparison of AFLPs, RAPD Markers, and Isozymes
for Diversity Assessment of Garlic and Detection of Putative Duplicates in
Germplasm Collections", J. Am. Soc. Hortic. Sci. (ISI), 128, 246-252 pp., 2003.
M.İpek, A.İpek, S.G.Almquist ve P.W.Simon, "Demonstration of Linkage and
Development of the First Low-Density Genetic Map of Garlic Based on AFLP
Markers", Theor. Appl. Genet. (ISI), 110, 228-236 pp., 2005.
A.İpek, P.Masson ve P.W.Simon, "Genetic transformation of an Ac/Ds-based
Transposon Tagging System in Carrot (Daucus carota L.)", Europ. J. Hort. Sci. (ISI)
,71, 245-251 pp., 2006, (Bu makale doktora tezinden hazırlanmıştır).
A.İpek, M.İpek ve P.W.Simon, "Association of Reversible Inactivation of Maize
Transposable Element, Ds, with Tissue-specific Processing of the 35S:TPase
Transcript in Carrot (Daucus carota L.)", J. Hortic. Sci. Biotech. (ISI), 81, 819-826 pp.,
2006, (Bu makale doktora tezinden hazırlanmıştır).
M.İpek, A.İpek ve P.W.Simon, "Sequence Homology of Polymorphic AFLP Markers
in Garlic (Allium sativum L.)", Genome (ISI), 49, 1246-1255 pp., 2006.
M.İpek,
A.İpek, D.Senalik ve P.W.Simon, "Characterization of an Unusual
Cytoplasmic Chimera Detected in Bolting Garlic Clones", J. Am. Soc. Hortic. Sci.
(ISI), 132, 664-669 pp., 2007.
M.İpek, A.İpek ve P.W.Simon, "Molecular Characterization of Kastamonu Garlic: An
Economically Important Garlic Clone in Turkey", Sci. Hortic. (ISI), 115, 203-208 pp.,
2008.
M.İpek, A.İpek ve P.W.Simon, "Genetic Characterization of Allium tuncelianum: An
Endemic Edible Allium Species with Garlic Odor", Sci. Hortic. (ISI), 115, 409-415 pp.,
2008.
M.İpek, A.İpek ve P.W. Simon, "Rapid Characterization of Garlic Clones with Locus
Specific DNA Markers", Turk. J. Agric. For (ISI), 32, 357-362 pp., 2008.
Y.Y.Yau, S.J.Davis,
A.İpek ve P.W.Simon, "Early Identification of Stable
Transformation Events by Combined Use of Antibiotic Selection and Vital Detection
of Green Fluorescent Protein (GFP) in Carrot (Daucus carota L.) Callus", Agr. Sci.
China , 7, 664-671 pp., 2008.
A.İpek, E.Barut, H.Gulen ve M.Ipek, "Genetic Diversity among Some Blackberry
Cultivars and Their Relationship with Boysenberry Assessed by AFLP Markers", Afr.
J. Bitechnol. (ISI), 8, 4830-4834 pp., 2009.
E.Barut, A.İpek ve H.Gulen, "Distribution of olive (Olea europaea L.) Genotypes in
the Southern Marmara Region of Turkey", Pak. J. Bot. (ISI), 41, 1077-1080 pp.,
2009.
Page 4 of 8
A.İpek, E.Barut, H.Gulen, A.T.Oz, N.A.Tangu ve M.Ipek, "SSR Analysis
Demonstrates That Olive Production in the Southern Marmara Region in Turkey
Uses a Single Genotype", Genet. Mol. Res (ISI), 8, 1264-1272 pp., 2009.
S.Ercisli, E.Barut ve A.İpek, "Molecular Characterization of Olive Cultivars Using
Amplified Fragment Length Polymorphism Markers", Genet. Mol. Res. (ISI), 8, 414419 pp., 2009.
A. İpek, E.Barut, H.Gulen ve M. Ipek, "Genetic Diversity Among Some Currants
(Ribes Spp.) Cultivars As Assessed by AFLP Markers", Pak. J. Bot. (ISI), 42, 10091012 pp., 2010.
H.Gülen, A. İpek, S.Ergin, M.E.Akcay ve A.Eriş, "Assessment of Genetic
Relationships Among 29 Introduced and 49 Local Sweet Cherry Accessions in
Turkey Using AFLP and SSR Markers", J. Hortic. Sci. Biotech. (ISI), 85, 427–431 pp.,
2010.
A.İpek, H.Gulen, M.E.Akcay, M. Ipek, S.Ergin ve A.Eris, "Determination of SelfIncompatibility Groups of Sweet Cherry Genotypes from Turkey", Genet. Mol. Res.
(ISI),, 10, 253-260 pp., 2011.
S.Ercisli, A. İpek, ve E. Barut, “SSR Marker-Based DNA Fingerprinting and Cultivar
Identification of Olives (Olea europaea)”, Biochem Genet. (ISI), 49, 555–561 pp.,
2011.
S.Ercisli, M.Radunic, J.Gadze, A.Ipek, M.Skaljac, Z.Cmelik, “S-RNase based Sgenotyping of Croatian sweet cherry (Prunus avium L.) genotypes”. Sci. Hortic. (ISI),
139, 21-24 pp., 2012.
A.Ipek, E.Barut, H.Gulen, M.Ipek, “Assessment of inter- and intra-cultivar variations in
olive using SSR markers”, Sci Agric. (ISI), 2012 (Basımda).
Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings)
basılan bildiriler :
A.İpek ve P.W.Simon, Congress on In Vitro Biology konferansı dahilinde "In Vitro, 35"
bildiri kitapçığındaki "Transposition of Non-autonomous Maize Transposable
Element, Dissociation (Ds), in Carrot", 38-A pp., New Orleans, ABD, 1999.
A.İpek ve P.W.Simon, American Society for Horticultural Sciences (ASHS) Annual
Conference konferansı dahilinde "Hortscience, 34" bildiri kitapçığındaki "Nonautonomous Maize Transposable Element Transposed in Carrot (Daucus carota L)",
453 pp., Minneapolis, ABD, 1999.
A.İpek ve P.W. Simon, Congress on In Vitro Biology konferansı dahilinde "InVitro, 37"
bildiri kitapçığındaki "Activation of Non-autonomous Maize Transposable Element,
Dissociation (Ds) by Ac-transposase in Carrot", 35-A pp., St. Louis, ABD, 2001.
A.İpek, ve P.W.Simon, The International Conference on the Status of Plant, Animal &
Microbe Genomes Research X konferansı dahilinde "Final Abstracts Guide" bildiri
Page 5 of 8
kitapçığındaki "Developing an Ac/Ds Based Two-element Transposon Tagging
System in Carrot", 252 pp., San Diego, ABD, 2002.
A.İpek ve P.W.Simon, The International Conference on the Status of Plant and
Animal Genome Research XI konferansı dahilinde "Final Abstracts Guide" bildiri
kitapçığındaki "Activation of an Inactive Ds (Dissociation) Element by Tissue Culture
in Carrot (Daucus carota L.)", 248 pp., San Diego, ABD, 2003.
A.İpek, M.İpek ve P.W.Simon, III. Balkan Symposium on Vegetables and Potatoes
konferansı dahilinde "Abstract Book" bildiri kitapçığındaki "Analysis of a SeedGenerated F1 Family of Garlic Using AFLPTM", 7 pp., Bursa, 2004.
A.Cansev, H.Gulen, A.İpek ve A.Eris, Plant Biology 2006 konferansı dahilinde
"Abstracts Book" bildiri kitapçığındaki "Seasonal Changes in Various Enzyme
Activities in Olive (Olea europae L.) Genotypes", 102 pp., Boston, ABD, 2006.
A.İpek, E.Turhan, N.Koksal, H Gulen ve A.Eris, International Conference on
Environment: Survival and Sustainability konferansı dahilinde "Proceeding" bildiri
kitapçığındaki "Carbohydrate Metabolism in Pepper (Capsicum Annum L.) Seedlings
Under High Temperature Stress", 753-760 pp., Nicosia, Northern Cyprus, Şubat
2007.
E.Turhan, H.Gulen, A.İpek ve A. Eris, International Conference on Environment:
Survival and Sustainability konferansı dahilinde "Proceeding" bildiri kitapçığındaki
"Antioxidative Enzyme Activities In Onion (Allium Cepa L.) Genotypes", 459-466 pp.,
Nicosia, Northern Cyprus, 2007.
N.Koksal, E.Turhan, A.İpek, H.Gulen ve A.Eris, International Conference on
Environment: Survival and Sustainability konferansı dahilinde "Proceeding" bildiri
kitapçığındaki "Clustering Of Some Local Common Bean (Phaseolus Vulgaris L.)
Genotypes Based on Carbohydrate Metabolism", 467-474 pp., Nicosia, Northern
Cyprus, Şubat 2007.
A.Eris, H.Gulen, E.Turhan, A.Cansev ve A.İpek, Second Annual YOK-SUNY
Collaboration Symposium konferansı dahilinde "Symposium Book" bildiri
kitapçığındaki "Studies on Cold, Heat, and Salinity Stressing Some Horticultural
Crops", 50-58 pp., Adana, 2007.
H.Gulen, A.İpek, M.Burak ve A.Eris, V. International Cherry Symposium, 2005
konferansı dahilinde "Acta Horticulturae, 795" bildiri kitapçığındaki "Assessment of
Genetic Diversity and Relationship Among Some Sweet Cherry Cultivars using AFLP
Markers", 127-130 pp., Bursa, 2008.
Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler
A.Eriş, G.A.Lang, H.Gülen ve A.İpek., Proceeding of the Fifth International Cherry
Symposium, 968 pp., Belgium, Acta Horticulturae No: 795, ISHS, 2008
Page 6 of 8
Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler
H.Gülen, A.İpek ve A.Eriş, II. Uluslararası katılımlı moleküler tanı ve uygulamaları
sempozyumu konferansı dahilinde "Özet Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Ayva
Anaçlarının İzoenzim Markörüne Göre Gruplanması", 44-47 pp., İzmir, 2004.
M.İpek, A.İpek, ve A.F.Gökçe, V. Sebze Tarımı Sempozyumu konferansı dahilinde
"V. Sebze Tarımı Sempozyumu Bildiriler" bildiri kitapçığındaki "Sarımsakta (Allium
sativum L.) Tohum Üretimi ve Islahında Gelişmeler", 273-277 pp., Çanakkale, 2004.
A.İpek ve P.W.Simon, XIV. Biyoteknoloji Kongresi konferansı dahilinde "XIV.
Biyoteknoloji Kongresi Bildiri ve Poster Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Agrobacterium
Sistemiyle Havuç Bitkisinde Gen Aktarımı", 36-39 pp., Eskişehir, 2005 (Bu makale
doktora tezinden hazırlanmıştır).
M.İpek, A.İpek ve P.W. Simon, XIV. Biyoteknoloji Kongresi konferansı dahilinde "XIV.
Biyoteknoloji Kongresi Bildiri ve Poster Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Sarımsak
Genomu Organizasyonunun PZR’a Dayalı Gen Spesifik Markırlarla Belirlenmesi", 6063 pp., Eskişehir, 2005.
A.Cansev, N.Köksal, H.Gülen, A.İpek ve A.Eriş, XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
konferansı dahilinde "Biyoteknoloji Kongresi Bildiri ve Poster Kitabı" bildiri
kitapçığındaki "Düşük Sıcaklık Stresi Altındaki Bazı Zeytin Çeşitlerinin Peroksidaz
Aktivitesine Göre Gruplanması", 313-317 pp., Eskişehir, 2005.
N.Köksal, A.Cansev, H.Gülen, A.İpek ve A.Eriş, XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
konferansı dahilinde "XIV. Biyoteknoloji Kongresi Bildiri ve Poster Kitabı" bildiri
kitapçığındaki "Bazı Yerel Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Arasındaki
Akrabalık İlişkilerinin Belirlenmesi", 304-307 pp., Eskişehir, 2005.
E.Turhan, H.Gülen, A.İpek ve A.Eriş, VI. Sebze Tarımı Sempozyumu konferansı
dahilinde "VI. Sebze Tarımı Sempozyumu Bildiri Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Fiziksel
ve Enzimatik Markırlar Kullanılarak Soğan (Allium cepa L.) Genotiplerinin
Gruplandırılması", 66-69 pp., Kahramanmaraş, 2006.
M.İpek, A.İpek, ve P.W.Simon, VII.Sebze Tarımı Sempozyumu konferansı dahilinde
"VII.Sebze Tarımı Sempozyumu Bildiri Kitabı" bildiri kitapçığındaki "Tunceli
Sarımsağı (Allium tuncelianum (Kollman) Özhatay, Matthew, Şiraneci) ve Sarımsağın
(Allium sativum L.) Morfolojik ve Genetik Olarak Karşılaştırılması", 210-212 pp.,
Yalova, 2008.
M.İpek, A.İpek, Ö.Günaydın ve P.W.Simon, XVI. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
konferansı dahilinde "XVI. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi Bildiri Kitabı," bildiri
kitapçığındaki "Sarımsakta Farklı İfade Olan Genlerin Analizi", 136-138 pp., Antalya,
2009.
E.Barut A.İpek ve H.Gulen, III. Ulusal Üzümsü Meyveler Sempozyumu konferansı
dahilinde "III. Ulusal Üzümsü Meyveler Sempozyumu Bildiriler Kitabı" bildiri
kitapçığındaki "AFLP Markırları Kullanılarak Bazı Böğürtlen Çeşitleri Arsındaki
Genetik Farklılığın Belirlenmesi", 211-215 pp., Kahramanmaraş, 2009.
Page 7 of 8
A. İpek, H. Gülen, M.E. Akçay, M. İpek, S. Ergin ve A. Eriş, 1. Ulusal Moleküler
Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi konferansı dahilinde “Bildiri Özetleri” bildiri
kitapçığındaki “Bazı yerel kiraz çeşitlerimizde S-allellerinin PCR yöntemi ile
belirlenmesi”, 6 pp., Antalya, 2010.
A. İpek, E. Barut, H. Gülen ve M. İpek, 1. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji
Kongresi konferansı dahilinde “Bildiri Özetleri” bildiri kitapçığındaki “Ülkemizde zeytin
üretiminde kullanılan bazı yerel zeytin çeşitlerimizin çeşit içi ve çeşitler arası genetik
varyasyonu” , 7 pp., Antalya, 2010.
M. İpek, A. İpek, Ö. Günaydın, ve Ç. Aydoğan, 1. Ulusal Moleküler Biyoloji ve
Biyoteknoloji Kongresi konferansı dahilinde “Bildiri Özetleri” bildiri kitapçığındaki
“Sarımsakta Farklı Gelişme Dönemlerinde Transkript Profilininin cDNA-AFLP
Yöntemi ile Belirlenmesi”, 33 pp., Antalya, 2010.
H. Gülen, S. Ergin, M.Kesici, E. Turhan, A. İpek ve N. Köksal, Uluslar arası Katılımlı I.
Ali Numan Kıraç Tarım Kongresi ve Fuarı konferansı dahilinde “Bildiriler, Cilt 1” bildiri
kitapçığındaki “Çilekte Yüksek Sıcaklığa Bağlı Çiçek Tozu Canlılığı ve Çimlenme
Oranı”, 811-815 pp., Eskişehir, 2011.
H. Gülen, E. Turhan, A. İpek, N. Köksal, A. Cansev, M. Kesici, A. ve Eriş, V. Ulusal
Bahçe Bitkileri Kongresi konferansı dahilinde “Bildiriler Kitabı, Cilt 1” bildiri
kitapçığındaki “Bazı çilek çeşitlerinde yüksek sıcaklığa toleransın belirlenmesi”, 32-36
pp., Erzurum, 2007.
Diğer yayınlar
N.Madson A.İpek ve P.W.Simon, “Mobile Genetic Elements in Carrot: Isolation and
Characterization of Ty1/ Copia-like Retrotransposons and Behavior of the Maize
Transposable Element, Dissociation”, SRP Biology, 75-80 pp, University of
Wisconsin, Madison, ABD, 2001.
M.Fernandez, M.İpek, A.İpek, ve P.W.Simon, “Development of a Phylogenetic Tree
in Garlic (Allium sativum L.) Using Targeted mtDNA-PCR and RAPD Analysis”, SRP
Biology, 51-54 pp, University of Wisconsin, Madison, ABD, 2001.
Page 8 of 8