Meme Kanseri Hastalarında JAM-A ve LFA

Transkript

MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE
LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN
İNCELENMESİ
Bengü TOKAT, 1,2 Deniz KANCA, Tülin ÖZTÜRK, M.Fatih SEYHAN, Zerrin CALAY, Şennur İLVAN,
Özlem KURNAZ-GÖMLEKSİZ, Hülya YILMAZ-AYDOĞAN, Oğuz ÖZTÜRK
1 İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, Moleküler Tıp AD, İstanbul Türkiye
2 Haliç Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, İstanbul Türkiye
4 Kasım 2015
SUNUM AKIŞI

GİRİŞ






Meme kanseri
JAM-A ve LFA-1
AMAÇ
METOT
BULGULAR
TARTIŞMA
XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ
4 KASIM 2015
MEME KANSERİ

Poligenetik malign hastalıklardan biri

ABD; Kadınlarda en yaygın 1. kanser türü


Erkek: 2300 yeni vaka/yıl
Kadın: 230000 yeni vaka/yıl
Kadın Meme Anatomisi
http://www.cancer.gov/types/breast
http://seer.cancer.gov/statfacts/html/breast.html
http://kanser.gov.tr/daire-faaliyetleri/kanser-kayitciligi/108t%C3%BCrkiyede-kanser-kayitcigi.html
3-6 KASIM 2015 ANTALYA
Neden JAM-A / LFA-1 ?

Kanser hücrelerinde yuvarlanma, bağlanma ve transmigrasyon /
diapedez adımlarıyla gerçekleşen ekstravazasyon, endotel hasarı
/ disfonksiyonuna bağlı lökosit ekstravazasyonuna benzemekte
olup endotel kökenli JAM-A ve monosit kökenli LFA-1 molekülleri
bu süreçte rol oynamaktadır.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471490612001329
http://jcs.biologists.org/content/117/1/19
Junctional Adhesion Molecule-A / Bağlantı
Adezyon Molekülü-A (JAM-A)







Hücreiçi bağlantı teşekkülü ve hücre polaritesi
Hücre morfolojisi
Anjiyogenez
Platelet aktivasyonu
Lökosit migrasyonu
Monosit ve nötrofil ekstravazasyonu
Normal meme dokusunda düşük düzeyde anlatımı yapılırken kanser
hücrelerinde anlatımı artmaktadır.



JAM-A geninin şematik diyagramı
Ekspresyon ↑  tümör hücre migrasyonu ↑  invazyon ve metastaz
Ekspresyon ↓  apoptoz ↑  kanser progresyonu ↓
Genin susturulması, JAM-A ‘nın epitel hücrelerin yayılma ve lökosit
migrasyonunu artırmasıyla kanser hücrelerinin adhezyon ve migrasyonunu
azaltarak kanser gelişimini azaltmaktadır.
Lymphocyte Function Associated Antigen 1 /
Lökosit Fonksiyon İlişkili Antijen-1(LFA-1)




Antijen spesifik cevaplar
Lenfosit tarafından hedeflenme
İnflamasyon bölgelerinde monosit ve nötrofil diapedezi
LFA-1 I domeini JAM-A için fonksiyonel bir bağlanma bölgesi
içermektedir.

JAM-A membran proksimal Ig domein 2 (D2)
LFA-1 I domeini
JAM-A homodimeri
JAM-A / LFA bağlanması
AMAÇ

Çalışmamızda tümör hücrelerinin ekstravazasyonunda rol
oynayan JAM-A ve LFA-1 hücre adhezyon
moleküllerindeki JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs8058823 ve
LFA-1 rs2230433 gen varyasyonlarının meme kanseri
riskine etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır.
JAM-A rs790056
LFA-1 rs8058823
LFA-1 rs2230433
Minör Allel
C
A
C
Majör Allel
T
G
G
YÖNTEM

İÜ Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Genel Cerrahi AD’da takip
edilen



PCR-RFLP (Fu et al., 2011)




108-meme kanseri hastası kadın
63-sağlıklı kadın
JAM-A rs790056 (int6 T>C)
LFA-1 rs8058823 (3’UTR A>G)
LFA-1 rs2230433 (8ex21 2120 G>C)
Verilerin analizi


SPSS-21.0 istatistik programı (p<0.05)
Haploview programı
BULGULAR
Tablo 1. Hastaların Karakteristik Özellikleri
Hasta Karakteristiği
Menopoz durumu
Histolojik derecesi
Östrojen Reseptör durumu
Progesteron Reseptör durumu
Lenfatik vasküler invazyon
In situ komponent
Perinöral invazyon
Nekroz
Kanser tipi
c-erb anlatımı
PrePostErken (1,2)
Geç (3)
ER(-)
ER(+)
PR(-)
PR(+)
Hayır
Evet
Hayır
Evet
Hayır
Evet
Hayır
Evet
Invasif duktal
Diğer
Hayır
Evet
n (%)
45 (49.5)
46 (50.5)
35 (56.5)
27 (43.5)
23 (30.3)
53 (69.7)
37 (48.7)
39 (51.3)
29 (54.7)
24 (45.3)
13 (26.0)
37 (74.0)
35 (68.6)
16 (31.4)
24 (48.0)
26 (52.0)
69 (87.3)
10 (12.7)
33 (44.6)
41 (55.4)
Tablo 2. Çalışma Gruplarında JAM-A ve LFAGenotiplerinin Dağılımı
Kontrol (n=63)
Gruplar
Hasta (n=108)
JAM-A rs790056 Genotipi
TT39 (61.9%)
CC8 (12.7%)
TC16 (25.4%)
69 (63.9%)
9 (8.3%)
30 (27.8%)
JAM-A rs790056 Allelleri
T94 (74.60%)
C32 (25.40%)
168 (77.78%)
48 (22.22%)
LFA-1 rs8058823 Genotipi
AA40 (63.5%)
GG7 (11.1%)
AG16 (25.4%)
87 (80.6%) *
21 (19.4%)
*, p=0.014
**, p=0.001 (Fisher’s
exact test)
***, p=0.048 (Fisher’s
exact test)
LFA-1 rs8058823 Allelleri
A96 (76.19%)
G30 (23.81%)
195 (90.28%) **
21 (9.72%)
LFA-1 rs2230433 Genotipi
CC16 (25.4%)
GG
GC47 (74.6%)
21 (19.4%)
7 (6.5%) ***
80 (74.1%)
LFA-1 rs2230433 Allelleri
C79 (62.70%)
G47 (37.30%)
122 (56.48%)
94 (43.52%)
Tablo 3. Çalışma Gruplarında JAM-A rs790056 (T>C),
LFA-1 rs8058823 (A>G) ve LFA-1 rs2230433 (C>G)
İkili Allel Haplotip Setlerinin Frekansları
Haplotip
Toplam
Frekanslar
Meme
kanseri
Kontrol
Ki kare
p değeri
JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs8058823
TA
CA
TG
CG
0.666
0.182
0.100
0.052
0.713
0.185
0.065
0.037
0.587
0.175
0.159
0.079
5.667
0.058
7.847
2.852
0.0173
0.8095
0.0051
0.0913
JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs2230433
TC
TG
CC
CG
0.441
0.325
0.147
0.087
0.437
0.341
0.128
0.094
0.448
0.298
0.179
0.075
0.04
0.669
4.652
0.369
0.8405
0.4134
0,1986
0,5435
LFA-1 rs2230433 ve LFA-1 rs8058823
CA
GA
CG
GG
0.462
0.386
0.126
0.026
0.482
0.417
0.083
0.019
0.429
0.333
0.198
0.040
0.896
2.332
9.59
1.389
0.3439
0.1267
0.002
0.2386
Tablo 4. Çalışma Gruplarında JAM-A rs790056, LFA1 rs2230433 ve LFA-1 rs8058823 Üçlü Allel Haplotip
Setlerinin Frekansları
Haplotip
Frekanslar
Toplam Meme Kontrol Ki kare p değeri
kanseri
(JAM-A rs790056,
LFA-1 rs2230433,
LFA-1 rs8058823)
TCA
TGA
CCA
TCG
CGA
CCG
CGG
0.352
0.313
0.109
0.091
0.074
0.036
0.016
0.377
0.336
0.104
0.060
0.082
0.024
0.012
0.311
0.274
0.116
0.144
0.060
0.056
0.021
1.511
1.391
0.128
6.711
0.54
2.365
0.406
0.2189
0.2383
0.7207
0.0096
0.4622
0.1241
0.524
BULGULAR

LFA-1 rs8058823 AA genotipi (p=0.014) ve A allel frekansı
(p=0.001) ve LFA-1 rs2230433 GG genotip frekansı (p=0.048)
hastalarda kontrol grubuna göre yüksektir.

Haplotip analizinde TA haplotip (JAM-A rs790056 T alleli - LFA1 rs8058823 A alleli) frekansı hasta grubunda kontrol grubuna
göre yüksek iken (p=0.0173), TG haplotip (JAM-A rs790056 T
alleli - LFA-1 rs8058823 G alleli) frekansı düşük (p=0.0051)
gözlenmiştir.

TCG haplotip (JAM-A rs790056 T alleli- LFA-1 rs2230433 C
alleli - LFA-1 rs8058823 G alleli) frekansı hasta grubunda
kontrol grubuna kıyasla düşüktür (p=0.0096).
TARTIŞMA

Çalışmamızda LFA-1



rs2230433 SNP için nadir GG genotipi ve G alleli ve
rs8058823 SNP için normal AA genotipi ve A alleli
vakalarda daha yüksektir.  RİSK FAKTÖRÜ
TARTIŞMA

Çin Han populasyonunda LFA-1 polimorfizmlerinin
incelendiği araştırmada (Fu et al, 2011)


rs2230433 SNP için GG genotipi ve G alleli ve
rs8058823 SNP için AA genotipi ve A alleli

vakalarda daha düşüktür.  KORUYUCU

rs2230433 CG genotipi ile
rs8058823 AG genotipi ise vakalarda daha yüksektir.

TARTIŞMA

Çalışmamızda;





LFA-1 rs8058823 nadir G allel frekansı (K: %23.81; H: %9.2) Çin,
Güney Asya ve Avrupa populasyonlarında daha yüksek iken,
Afrika populasyonlarına daha yakın,
LFA-1 rs2230423 nadir G allel frekansı (K: %37.3; H: 43.52) ise
Avrupa, Afrika ve Çin populasyonlarında daha düşük iken,
Güney Asya populasyonlarına daha yakın olarak belirlenmiştir.
Etnik köken,
Çevresel alt yapı,
Diğer faktörler
TARTIŞMA


JAM-A rs790056 T alleli + LFA-1 rs8058823 A alleli
meme kanseri riskini ↑
JAM-A rs790056 T alleli + LFA-1 rs8058823 G alleli 
meme kanseri riskini ↓
TEMEL LİMİTASYON

Çalışma populasyonu görece küçük olduğundan LFA-1
rs8058823 ve LFA-1 rs2230433 SNPlerine ait nadir GG
genotip frekansları da az gözlenmiştir (Tablo 2).

Bu varyasyonların meme kanser hastalarında klinikopatolojik
karakteristik alt gruplamaları üzerine etkisi istatistiksel olarak
analiz edilememiştir.
SONUÇ

LFA-1 ve JAM-A gen varyasyonları meme kanser riski için
kullanışlıdır.

LFA-1 ve JAM-A genlerinin meme kanseri gelişiminde rol
oynayan lökosit migrasyonu üzerine etkisi daha büyük
örneklem grupları ve bu genlere ait daha fazla SNP ile
araştırılmaya devam edilmelidir.
DİNLEDİĞİNİZ İÇİN TEŞEKKÜRLER 

Meme Kanseri Hastalarında JAM-A ve LFA

Transkript

Benzer belgeler

Önceki Yıllara Ait Yayın, Sözlü Bildiri ve Poster Künye Örnekleri

3 kasım 2010

Kasım - antalya il kültür ve turizm müdürlüğü

kanser tanı ve tedavisinde bireysel tıp uygulamaları

Dr. Bahram Sarkarati e-posta : [email protected]

“Field Application Engineer” SATIŞ

30.06.2016 tarihli Sabah Gazetesinde Yayınlanmıştır. ALANYA