Glikoliz - WordPress.com
Transkript
Glikoliz - WordPress.com
GLİKOLİZ Prof.Dr.İzzetHamdiÖğüş [email protected] YakınDoğuÜniversitesiTıpFakültesi BiyokimyaAnabilimDalı,LeEoşa,KKTC Glikoliz • Glikoliz, Yunanca glykys (tatlı, şeker) ve lysis (bölünme, parçalanma) ve sözcüklerinden kaynağınıalır. • Bir molekül glukoz ardışık 10 enzimaNk tepkime sonundaüçkarbonluikiadetpiruvatadönüşür. • Glikolizin ardışık tepkimleri sonunda elde edilen serbestenerjiATPveNADPHşeklindesaklanır. • BuolaydaO2harcanmaz. • Glikoliz birçok memeli dokusunun (eritrositler, böbrek medüllası, beyin ve sperm) tek metabolik enerjikaynağıdır. Glikoliz-Tarihçe 1860 Pasteur FermentasyonàVitalisJkgörüş 1828 Wöhler Laboratuvardaüresentezi 1897 1905 Hans&EduardBuchner Sukrozunparçalanması (VitalisJkgörüşünyıkılması) (EduardBuchnerà1907NobelKimyaödülü) ArthurHarden&WilliamYoung GlukozàHeksozdifosfat Zimaz (Diyalizeedilemez,ısıVncaakJvite(-) Kozimaz(Diyalizeedilebilir,ısıVncaakJvite(+) 1940 Glikolizbütünbasamaklarıylatanımlandı Embden–MeyerhofMetabolikYolu GLİKOLİZİNÖZELLİKLERİ • • • • • BütünglikoliNkenzimlersitoplazmadadır. Glikoliz,enerjikaynağıolanevrenselmetabolikbir yoldur. Glukozvepiruvatdışındakibütünarabileşiklerfosforile durumdadır. Fosfatgrupları,pH=7.4’teiyonizeve(-)yüklüdür. • Arabileşiklerdışarıkaçamaz • ADP’denATPoluşmasıiçinkullanılır. • EnzimleriçinbirerkimlikkarXgörevinigörürler, Substratlardahaiyitanınırlar. HemenbütünenzimleriçinMg++iyonugereklidir.(Bazı canlılardabazıenzimlerdeMn++). Mg++ - ATP Kompleksi Mg++ GLİKOLİZİNÖZELLİKLERİ Glikoliz10tepkimedenoluşur.Butepkimeleri ikigruptatoplayabiliriz. A) AkJvasyonbölümü • İlk(5)tepkimedeATPenerjisiharcanarak moleküllerakNveedilir.Buaşamadaenerji eldeedilmez. • Bubölümdekiikitepkimetersinmezdir. B)Fosforilasyonbölümü • Dahasonraki(5)tepkimedeATPsentezi içinkullanılır. • Bubölümdekisontepkimetersinmezdir. Fosforilasyon Glukoz ATPà 2x Piàà 1 ADPà Glukoz-6-fosfat 2x ATPà 4 5 7 ATPàà 3-fosfogliserat 3 ADPà Fruktoz-1,6-difosfat Dihidroksiaseton fosfat 2x 6 1,3-difosfogliserat ADPà à 2 Fruktoz-6-fosfat Gliseraldehit-3-fosfat 8 2x 2-fosfogliserat 9 Gliseraldehit-3fosfat AkNvasyon 2x 2x ADPà à PEP 10 Piruvat ATPà à #1 Glikolizdeilkenzim:HEKZOKİNAZ Tersinmezbirtepkimedir. hekzokinaz Glukoz ΔGo’=-16.7kJ/mol Glukoz-6-fosfat İlkbasamakta,ATPfosforilgrubuvericisiolarak kullanılırveglukozakNveedilir. GlikolizinDüzenlenmesi:HEKZOKİNAZveGLUKOKİNAZ Hekzokinaz(HK) • • • • • • Glukozunglikolizegirmesinikatalizeeder. Dört izozimi vardır (HK I-IV) ve kas dokusunda ilk üç izozimbulunur(HKI–III). Kashekzokinazı(HK-II)glukozayüksekaffinitegösterirve Kmdeğeri0.1mM’dır. Kashekzokinazları(HKIveII)G-6-Ptaragndanallosterik olarakinhibeedilirler. KCvekasdokularındakifarklıhekzokinazlarbuorganların farklı rollerini yansıXr. Kas dokusu enerji üreNmi için glukozkullanırkenKCkanglukozhomeostazıiçinçalışır. Karaciğerdeki baskın hekzokinaz izozimi Np IV’tür. HK-4 glukokinazolarakdaadlandırılır. GlikolizinDüzenlenmesi:HEKZOKİNAZveGLUKOKİNAZ • HekzokinazIV • HekzokinazI BağılenzimakJvitesi • (Glukokinaz)10mM glukozderişimindeyarı doymuşdurumdadır. GlukokinazG-6-P taragndaninhibe edilmezkendiğer izozimler(HK1-3)bu molekültaragndan inhibeedilirler. Glukokinazhücre çekirdeğindeyerleşik birdüzenleyici proteinintersinir olarakbağlanmasıyla inhibeedilir. HekzokinazIV (glukokinaz) Glukozderişimi(mM) Glukozderişimi(mM) GKAKTİVİTESİGLUKOZVEF-6-PİLEDENETLENİR • Glukokinazınçekirdekte regülatörproteinGKRP’ye bağlanmasıileenzimakNvitesitamameninhibeolur. • Kanglukozdüzeyindeki arXş,enziminçekirdekten sitoplazmayaçıkmasınıve akNvitesininartmasını sağlar. • EğerF-6-Pdüzeyiyüksekse, enziminsitoplazmadan nükleusataşınmasınıuyarır. #1 HekzokinazveGlukokinaz Km Substrat özgüllüğü G-6-Pile inhibisyon Hekzokinaz Glukokinaz 10-4M 10-2M • Glukoz • Mannoz • Glukoz • 2-deoksiglukoz • Glukozamin + - #2 deBruyn-vanEckensteindönüşümü O=C-H | H-C-OH | OH-C-H | Glukoz OH-C-H || H-C-OH | OH-C-H | enediol OH-CH2 | C=O | H-C-H | Fruktoz O=C-H | OH-C-H | OH-C-H | Mannoz #2 İkincitepkimebirizomerazilebaşarılır. Aldozfosfatketozfosfataçevrilir. Sorumluenzim: FOSFOHEKSOZİZOMERAZ ΔGo’=+1.7kJ/mol Fosfoheksoz izomeraz Glukoz-6-fosfat Fruktoz-6-fosfat #3 FOSFOFRUKTOKİNAZ-I(PFK-I) Tersinmezbirtepkimedir. Glikolizinenönemlikontrolbasamağıdır. Fosfofruktokinaz (PFK-I) Mg2+ ATP ADP Fruktoz-6-fosfat ΔG ’=-14.2kJ/mol o Fruktoz-1,6difosfat GlikolizinAllosterikDüzenlenmesi:PFK-I Fosfofruktokinaz-I (PFK-1) : Dört altbirimden oluşur ve her altbirimin kendi akNf merkezi, akNvatör ve inhibitörler için düzenleyicibağlanmabölgelerivardır. İnakNf (dimer) F-2,6-difosfat ADP AMP AkNf + (tetramer) ATP Sitrat UZYA AseJl-CoA £ATP F-6-P % Vm % Vm ¤ATP F-6-P #3 FOSFOFRUKTOKİNAZ–KineJközellikleri F-2,6-DP % Vm % Vm ¤ATP £ATP F-6-P F-2,6-DP % Vm F-6-P AMP AMP+ Sitrat - AMP F-6-P ALDOLAZ #4 • Aldolkırılmasıtepkimesinikatalizeeder. • Fruktoz-1,6-difosfat aldolaz tepkimesi ile 3 karbonlu bir aldozfosfatve3karbonlubirketozfosfatverir Adolaz F-1,6-DP ΔGo’=+23.9kJ/mol DHAP GA3P #4 ALDOLAZTEPKİMESİ-Mekanizma H2O N E Schiffbazı H2N E N H2O E FOSFOTRİOZİZOMERAZ #5 • Enediolaracılıdönüşümükatalizeeder. • Dihidroksiasetonfosfa.an(DHAP)gliseraldehit-3fosfat(GA3P)oluşur. DHAP Enediol GA3P ΔGo’=+7.6kJ/mol Böylece,glikolizinilkyarısında,(1)molglukozdan(2) molGA3Poluşur. Fosforilasyon Glukoz ATPà 2x Piàà 1 ADPà Glukoz-6-fosfat 2x ATPà 2x 8 2x 2-fosfogliserat 4 Dihidroksiasetonfosfat 9 Gliseraldehit 2x -3-fosfat 5 AkNvasyon 7 ATPàà 3-fosfogliserat 3 ADPà Fruktoz-1,6-difosfat 6 1,3-difosfogliserat ADPà à 2 Fruktoz-6-fosfat Gliseraldehit-3-fosfat 2x PEP ADPà à 10 ATPà à Piruvat #6 GLİSERALDEHİT-3-FOSFATDEHİDROGENAZ Pi,NAD+ NADH+H+ ≈ Mg2+ GA3P ΔGo’=+6.3kJ/mol 1,3-DPGA (3-fosfogliseroilfosfat) GA3PDehidrogenaztepkimesibirçokyöndenönemlidir: 1. Enziminhibisyonmekanizmasıanlaşılanilkenzimdir. 2. Tepkimeinorganikfosfatdoğrudankullanılır.Dahasonraki aşamadaATPsentezindekullanılacakXr. 3. Substra.an,NADkullanarakelektronlarıalantektepkimedir. 4. Tepkimedeyüksekenerjilibirbileşikortayaçıkar (1,3-difosfogliseratyada3-fosfogliseroilfosfat). GA3PDTEPKİMESİ-Mekanizma #6 NAD+ GA3P NAD+ e- S NADH E S E SH E NAD+ S NAD+ 1,3-DPG Pi E NADH+H+ #6 A) GA3PDehidrogenaz-İnhibitörler -SH +Hg+ Civa -S-Hg +H+ -COO- -SH + ClHg- - -COO- +Cl -S-Hg- B) Para-kloromerküribenzoat(PCMB) C) -S- CH2CONH2 +H++l- -SH + ICH2CONH2 İyodoasetamid İyodoasetatda–SHgrubunasaldıranbirorganikcivabileşiğidir. Arsenat H2AsO3- NADH+H+ D) GA3PD NAD+ GA3P O-AsO3H- ≈ H2AsO3- Hidroliz 3-Fosfogliseroilarsenat 3-PGA #7 FOSFOGLİSERATKİNAZ ATP ADP ≈ Mg2+ ΔGo’=-18.8kJ/mol 1,3-DPGA (3-fosfogliseroilfosfat) 3-PGA Substratdüzeyindefosforilasyon #8 FOSFOGLİSEROMUTAZ-TepkimeMekanizması 2-PGA 3-PGA E E E O OH O P P P P P P 3-PGA 2,3-DPGA 2-PGA • 2,3-Bisfosfogliserat(2,3-BPG)enziminfosforilasyonuiçingereklidir. • 2,3-BPGhücrelerdekataliNkmiktarlardabulunur. • Eritrositlerdeyüksekderişimdebulunur,çünküakciğerlerdendokularak oksijentaşınmasındaönemlibirroloynarlar. #9 ENOLAZ Dehidrasyon F- Mg2+ 2-PGA H2O ΔGo’=+1.7kJ/mol PEP #10 PİRUVATKİNAZ ADP ATP Mg2+ PEP ΔGo’=-31.4kJ/mol enol-Piruvat Substratdüzeyindefosforilasyon 1. Glikolizinsonbasamağı 2. Substratdüzeyindefosforilasyon 3. Tersinmezliğienfazlaolantepkime keto-Piruvat PİRUVATKİNAZINALLOSTERİKKONTROLU #10 İnakNf (dimer) + F-1,6-difosfat AMP AkNf (tetramer) ATP Alanin İzozim Doku KineJk M1 Kas,Beyin,Kalp MichaelisMenten - + - M2(K) Böbrek,KC(%50) Kısmen sigmoid + + -+ Sigmoid + + + L KC(%50), Alyuvar FDPile ATPile akJvasyon inhibisyon Hormonal kontrol (fosforilasyon) GLİKOLİZDETEPKİMEMODELLERİ 1. Fosforilgrubuaktarımı Hekzokinaz Fosfofruktokinaz(PFK) 2. Fosforilgrubukaydırma Fosfoglukomutaz 3. İzomerizasyon Fosfoheksozizomeraz Fosfotriozizomeraz 4. Dehidrasyon Enolaz 5. Aldolkırılması Aldolaz 6. Oksidasyon Gliseraldehit-3-fosfatdehidrogenaz GLİKOLİZDEENERJİBİLANÇOSU Tepkime 1 Hekzokinaz 2 Fosfoheksozizomeraz 3 Fosfofruktokinaz(PFK) 4 Aldolaz 5 Fosfotriozizomeraz 6 Gliseraldehit-3-fosfatdehidrogenaz 7 Fosfogliseratkinaz 8 Fosfoglukomutaz 9 Enolaz 10 Piruvatkinaz NetSonuç Harcanan Eldeedilen 1ATP - - - 1ATP - - - - - 2Pi,2NAD+ 2NADH 2ADP 2ATP - - - - 2ADP 2ATP 2ADP,2Pi 2ATP 2NAD+ 2NADH PİRUVATINDÖNÜŞÜMYOLLARI GA3PDehidrogenaztepkimesindeoluşanNADH’ın oksideolabilmesiiçincanlılardaçeşitliyollarkullanılır. A) Anaerobikkoşullarda 1.LakNkasitoluşumu LDH Piruvat+NADH+H+ Laktat+NAD+ ↔ 2. Etanololuşumu Piruvatdekarboksilaz Piruvat Asetaldehit+CO2 → Alkoldehidrogenaz Asetaldehit+NADH+H+ Etanol+NAD+ ↔ B) Aerobikkoşullarda NADHüzerindekielektronlar,gliserofosfatyadamalataspartatmekikleriaracılığıylamitokondriyeaktarılırve NAD+yenidenkazanılır.