Slayt 1 - TUCr2012

BĠR ZAMANLAR KRĠSTALOGRAFĠ
PROF. DR. AHMET ERDÖNMEZ
ĠZMĠR 2012
 Kristalografinin Teorisi
 Öncül ÇalıĢmalar
 H.Ü deki Asistanlık Yıllarım
 Deneysel Veri Toplama
 Hesaplamalar
 Ġlk Makalem
 Hollanda’ da Leiden Üniversitesindeki Doktora
Sonrası ÇalıĢmalar
 TanıĢtığım Bazı Önemli Kristalograflar
 OMU’ deki ÇalıĢmalar
 Sonuç
1895’te Alman fizikçi Wilhelm RONTGEN
tarafından X-ıĢınları keĢfedilmiĢtir. (Nobel ödüllü)
X-ıĢınlarının kristallerden kırınımını keĢfeden Max
von LAUE 1914 yılında Nobel ödülünü almıĢtır.
Laue Tekniği
X-IġINI TÜBÜ
Coolidge tübü
X-IġINI KAYDEDĠLMESĠ
FOTOĞRAFĠK FĠLMLER
SAYAÇLAR
Geiger-Müller sayacı
X-IġINI KIRINIMI VE BRAGG KANUNU
Nobel Ödüllü baba ve oğul
2dsinθ = nλ
Sir William Henry Bragg
Sir William Lawrence Bragg
X-IġINLARI ġĠDDETĠNĠ ETKĠLEYEN FAKTÖRLER
I(hkl) = K.L.P.T.A |F(hkl)|2
•
•
•
•
•
K: Skala Faktörü
L: Lorentz Faktörü
P: Polarizasyon Faktörü
T: Debye-Waller Sıcaklık Faktörü
A: Soğurma Faktörü
KRĠSTAL YAPI TAYĠNĠ
FAZ PROBLEMĠ
PATTERSON YÖNTEMĠ
DĠREKT YÖNTEMLER
FAZ TAYĠNĠ
F  Fhkl exp i 
hkl
PATTERSON YÖNTEMĠ
P(u)    ( x)  ( x  u)dx
PATTERSON FONKSİYONU
Z
Z
PATTERSON
2
a
2
1
h
PATTERSON KRİTERİ
DĠREKT YÖNTEMLER
 E E sin   
tan  
 E E cos   
k
hk
k
hk
k
hk
k
hk
k
h
k
JEROME KARLE
HERBERT A. HAUPTMAN
(Nobel ödüllü-1985)
(Nobel ödüllü-1985)
ISABELLA KARLE
TANJANT BAĞINTISI ĠLE YENĠ FAZLAR BULUNUR.
1
 ( x, y, z )   Fhkl exp 2ihx  ky  lz 
V
ELEKTRON YOĞUNLUĞU FONKSĠYONU
KRĠSTAL YAPI ARITIMI
R
F
ölç
hkl
(hkl)  Fhes (hkl)
F
ölç
(hkl)
hkl
Güvenilirlik Faktörü
ÖNCÜL ÇALIġMALAR
Dorothy HODGKIN
Makromolekül yapıların
bazılarını çözdü (1964 Nobel
Ödülü).
Rosalind FRANKLIN
DNA yapısının belirlenmesinde
katkısı oldu.
Maurice WILKINS
Nobel Ödüllü
HACETTEPE
ÜNĠVERSĠTESĠNDEKĠ
ASĠSTANLIK YILLARIM
DOKTORA HOCAM PROF. DR. DĠNÇER ÜLKÜ
HACETTEPE ÜNĠVERSĠTESĠNDEKĠ
ASĠSTANLIK YILLARIM
Ġki genç asistan…
DENEYSEL VERĠ TOPLAMA
Debye-Scherrer
Kamerası
Debye-Scherrer
Geometrisi
Debye-Scherrer Filmleri
Debye-Scherrer
Konileri
TOZ VEYA TEK KRĠSTAL MANUAL SPEKTRUMU
Toz örneklerin belirlenmesi
 Ġlk
Ģiddetli üç yansımanın hkl, d ve I/I0 değerleri listelenir.
Buradan Hanawalt indeksine gidilerek ASTM kart numarası
bulunur. Daha sonra o numaralı karta gidilerek bu örneğin bir
bilgi kartına ulaĢılır.
 Bu kartta o örnekle ilgili tüm yansımaların hkl, d ve I/I0
değerleri listelenmiĢtir. Ayrıca örneğin adı kimyasal formülü ve
benzeri bilgiler bulunmaktadır.
 Örnek birden fazla faz da içerebilir.
LAUE TEKNĠĞĠ
Laue geçirme tekniği
Laue geri yansıma
tekniği
Laue Filmi
BUERGER PRESESYON TEKNĠĞĠ
M.J.
BUERGER
BUERGER GEOMETRĠSĠ
BUERGER FĠLMLERĠ
KENDĠ ÇALIġMAMIZ
WEISSENBERG TEKNĠĞĠ
Weissenberg döner kristal
tekniği filmi
WEISSENBERG KAMERA
Weissenberg integre filmi
Weissenberg integre filminin indislenmesi
ġĠDDET ÖLÇÜMÜ
MĠKRODENSĠTOMETRE
ġĠDDET PĠKLERĠ
VERĠ KODLAMA KAĞIDI
KART DELME MAKĠNASI
HOLLERITH KARTLARI
DelinmemiĢ kart
SOĞURMA GRAFĠKLERĠ
ġĠDDET VERĠLERĠ KULLANILARAK
YAPILAN HESAPLAMALAR
FOURIER ELEKTRON YOĞUNLUĞU
HARĠTASI
FARK FOURĠER
HARĠTASININ
PROJEKSĠYONU
YAPISI
ÇÖZÜLMÜġ
MOLEKÜLÜN
ÇĠZĠMĠ
ĠLK MAKALEM
ZEITSCHRIFT FUR KRISTALLOGRAPHIE
THE CRYSTAL-STRUCTURE OF DIBROMOBIS(3,5-DIMETHYLPYRIDINE)MANGANESE(II)
aERDÖNMEZ,
Volume: 165
aHACETTEPE
A., aULKU, D.
Issue: 1-4
Pages: 241-245
Published: 1983
UNIV, DEPT PHYS, ANKARA, TURKEY
Hollanda’ da Leiden Üniversitesindeki Doktora
Sonrası ÇalıĢmalar
Beraber çalıĢtığım Prof. Dr. Jan REEDIJK
Terminal baĢında…
Datayı toplayan
teknisyen
Syb GORTER
TANIġTIĞIM BAZI ÖNEMLĠ MESLEKTAġLAR
Eski IUCr BaĢkanı H.
SCHENK ve BEN
G. SHELDRICK ile yemek yerken…
ECA BAġKANI SANTIAGO GARCIA
GRANDA ĠLE BOĞAZDA YEMEK
YERKEN…
Madrid’te Santiago ile birlikte…
Tom Steitz ile Madrid’te…
Kristalograflar bir arada……
DÖRTLÜ ÇEMBER DĠFRAKTOMETRESĠ
KAPPA EKSEN DĠFRAKTOMETRESĠ
ALÇAK SICAKLIK DÜZENEĞĠ
GONYOMETRE ÇALIġIRKEN
GÖRÜNTÜ LEVHASI
CCD DEDEKTÖR
ALÇAK SICAKLIKTA YAPI TAYĠNĠ
OMU’ DEKĠ ÇALIġMALAR
STOE IPDS II
DĠFRAKTOMETRESĠ
CCD ( Charge Coupled Device) KAMERALAR
IMAGE PLATE
ÇALIġILAN KRĠSTALLERDEN ÖRNEKLER
GONYOMETRE BAġLIĞINDA BĠR TEK KRĠSTAL
BĠR BAġKA KRĠSTAL VE
ÇÖZÜLMÜġ YAPISI
Kristal örneği seçilirken…
Data değerlendirilirken…
GENÇLER HESAP YAPARKEN…
HESAPLARI TARTIŞIRKEN…
SONUCA ULAŞMANIN HUZURU
BİZİM GENÇLERİMİZ…
YAPILAN YAYINLARA BĠR ÖRNEK
YAPININ ORTEP 3 ĠLE ÇĠZĠLMĠġ ġEKLĠ
Grubumuzda 6 profesör, 5 doçent, 5 yardımcı doçent, 5 doktor, 18
doktora ve yüksek lisans öğrencisi çalıĢmaktadır.
Prof. Dr. AHMET ERDÖNMEZ
Doç. Dr. CANAN KAZAK
Prof. Dr. ORHAN BÜYÜKGÜNGÖR
Doç. Dr. ġAMĠL IġIK
Prof. Dr. MUHARREM DĠNÇER
Doç. Dr. HÜMEYRA PAġAOĞLU
Prof. Dr. NEZĠHE ÇALIġKAN
Doç. Dr. UFUK ÇORUH
Prof. Dr. ĠSMET ġENEL
Doç. Dr. NAZAN OCAK ISKELELĠ
Prof. Dr. AHMET BULUT
Yrd. Doç. Dr. ġEHRĠMAN ATALAY
Yrd. Doç. Dr. NECMĠ DEGE
Yrd. Doç. Dr. YAVUZ KÖYSAL
Yrd. Doç. Dr. ÇĠĞDEM YÜKSEKTEPE
Yrd. Doç. Dr. BAġAK KOġAR
Dr. HANDE PETEK
Dr. ARZU ÖZEK
Dr. NAMIK ÖZDEMĠR
Dr. SÜHEYLA YÜCE
Dr. GÖKHAN KAġTAġ
DOKTORA VE YÜKSEK LĠSANS ÖĞRENCĠLERĠ
ONUR ġAHĠN
SERAP YAZICI
ÖZLEM DEVECĠ
GÖKHAN ALPASLAN
GONCA ÖZDEMĠR
TUFAN AKBAL
YELDA ALPASLAN
SĠBEL DEMĠR
ZEYNEP KELEġOĞLU
SĠBEL ġAHĠN
BURCU ASLAN
HAKAN KARGILI
ERSĠN TEMEL
MARĠFE TÜFEKÇĠ
GÜNEġ DEMĠRTAġ
IġIN KILIÇ
TUBA AK
ERSĠN ĠNKAYA
NOBEL ÖDÜLLÜ KRİSTALOGRAFLAR
2009 Chemistry
V. Ramakrishnan, T.A. Steitz, A.E. Yonath
Studies of the structure and function of the ribosome
2006 Chemistry
R.D. Kornberg
Studies of the molecular basis of eukaryotic transcription
2003 Chemistry
R. MacKinnon
Potassium channels
1997 Chemistry
P.D. Boyer, J.E. Walker, J.C. Skou
Elucidation of the enzymatic mechanism underlying the synthesis of adenosine triphosphate (ATP) and
discovery of an ion-transporting enzyme
1996 Chemistry
R.Curl, H. Kroto, R. Smalley
Discovery of the fullerene form of carbon
1994 Physics
C. Shull and N. Brockhouse
Neutron diffraction
1992 Physics
G. Charpak
Discovery of the multi wire proportional chamber
1991 Physics
P.-G. de Gennes
Methods of discovering order in simple systems can be applied to polymers and liquid crystals
1988 Chemistry
J. Deisenhofer, R. Huber, H. Michel
For the determination of the three-dimensional structure of a photosynthetic reaction centre
1985 Chemistry
H. Hauptman and J. Karle
Development of direct methods for the determination of crystal structures
1982 Chemistry
A. Klug
Development of crystallographic electron microscopy and discovery of the structure of
biologically important nucleic acid–protein complexes
1976 Chemistry
W.N. Lipscomb
Structure of boranes
1972 Chemistry
C.B. Anfinsen
Folding of protein chains
1964 Chemistry
D. Hodgkin
Structure of many biochemical substances including Vitamin B12
1962 Physiology or Medicine
F. Crick, J. Watson, M. Wilkins
The helical structure of DNA
1962 Chemistry
J.C. Kendrew, M. Perutz
For their studies of the structures of globular proteins
1954 Chemistry
L.C. Pauling
For his research into the nature of the chemical bond and its application to the elucidation of
the structure of complex substances
1946 Chemistry
J.B. Sumner
For his discovery that enzymes can be crystallised
1937 Physics
C.J. Davisson and G. Thompson
Diffraction of electrons by crystals
1936 Chemistry
Petrus (Peter) Josephus Wilhelmus Debye
For his contributions to our knowledge of molecular structure through his
investigations
on dipole moments and on the diffraction of X-rays and electrons in gases
1929 Physics
L.-V. de Broglie
The wave nature of the electron
1917 Physics
Charles Glover Barkla
Discovery of the characteristic Röntgen radiation of the elements 1915 Physics
W.H. Bragg and W.L. Bragg
Use of X-rays to determine crystal structure
1914 Physics
M. Von Laue
Diffraction of X-rays by crystals
1901 Physics
W.C. Röntgen
Discovery of X-rays
TEġEKKÜRLER…