Using a certificate and Simple Job Submission

Transkript

Using a certificate and Simple Job Submission
Kullanıcı Pratik
Eğitimi
Özgür Erbaş
[email protected]
www.grid.org.tr
Kullanıcı Arayüzüne Erişim
• Kullanıcı arayüzüne ssh ile bağlanın
- Putty
- Kullanıcılar: egitim(1-50)
- Sunucu: egitim-ui.ulakbim.gov.tr
• globus dizininin varlığını kontrol edin
ls –laR .globus
drwxr-xr-x 2 root root
drwx------ 31 root root
-rw-r--r-- 1 root root
-rw------- 1 root root
4096 Aug 15 13:57 .
4096 Feb 10 15:32 ..
0 Mar 14 2006 usercert.pem
963 Mar 14 2006 userkey.pem
• Pratik eğitim için gerekli örnek dosyaları kullanıcı dizininize açın:
cd ~
tar zxvf /home/egitim.tar.gz
Çalışabileceğiniz Kaynakları Görüntülemek
• Herhangi bir sanal organizasyon için o an geçerli çalışabileceğiniz
kaynakları görüntülemek için:
lcg-infosites --vo <VO>
• sgdemo sanal organizasyonunda çalışılabilecek işlemcileri görmek için:
lcg-infosites --vo sgdemo ce
• sgdemo sanal organizasyonunda veri saklama alanını görmek için:
lcg-infosites --vo sgdemo se
lcg-infosites --vo sgdemo closeSE
• Sorgulanabilecek diğer özellikleri görmek için:
lcg-info --list-attrs
• sgdemo sanal organizasyonu içinde MPI destekleyen kümelerin işlemci ve
lcg-info –vo sgdemo --list-ce --query 'Tag=MPICH' --attrs 'FreeCPUs'
Kullanıcı Sertifikanız
Bir X.509 sertifikası şu bilgileri içerir:
Kullanıcı açık anahtarı;
Açık Anahtar
Kullanıcı hakkında bilgi;
Sertifika otoritesi bilgisi;
Geçerlilik süresi;
Sertifika otoritesinin imzası
Subject: C=TR, O=TRGrid,
OU=TUBITAK-ULAKBIM,
CN=Onur Temizsoylu
Issuer: C=TR, O=TRGrid, CN=TRGrid CA
Validity
Sertifikanızı incelemek için:
grid-cert-info
Not Before: Feb 5
10:05:58 2007 GMT
Not After : Feb 5
10:05:58 2008 GMT
Sertifika Otoritesi İmzası
Proxy Oluşturmak
• Çalışmak için proxy oluşturun:
voms-proxy-init --voms sgdemo
Passphrase: keyforcert
• Oluşturduğunuz proxy hakkında bilgi edinin
voms-proxy-info --all
• Oluşturduğunuz proxy’i yok etmek için
voms-proxy-destroy
İşinizi Çalıştırmadan Önce
• Bilmeniz gerekenler:
• Hangi programlar gönderilecek?
• Hangi veriye erişilecek, veri program ile birlikte mi
gidecek?
• Herhangi bir işletim sistemi, kütüphane bağımlılığı
var mı?
• Gönderdiğiniz uygulama:
• Bilinmeyen bir sistemde çalışabilmeli
• Çalışma dizini dışında yer alacak şekilde sabit
olarak belirlenmiş dizinler ve dosyalar içermemelidir.
Grid Dünyasının Dili - JDL
• Job Description Language (JDL)
Condor ClassAd dili standardında geliştirilmiştir.
• Bir JDL dosyası niteliklerle oluşturulur:
<nitelik> = <anahtar>;
• Nitelikler temel olarak ikiye ayrılabilir:
- İş nitelikleri, işin kendini tanımlar
-Kaynak nitelikleri, işe uygun kaynakları bulunmasını
sağlar.
• #, // veya /* */ ile JDL içine açıklama satırları yazılabilir.
JDL Dosyası
• Nitelikler, JDL parçalayıcının(parser) hatasız bir
şekilde çözümleme yapması için...
• Tüm iş tanımlar köşeli parantezler içinde
olmalıdır. Örnek: [ <iş tanımı>]
• Her tanım satırı noktalı virgul ile ayrılmalıdır.
•JDL boşluk karakteri ve tablara duyarlıdır.
JDL Nitelikleri (1)
JobType Normal (basit, seri iş), Interactive, MPICH, Checkpointable
Executable – Çalıştırılacak komut
Arguments – Komuta verilecek argümanlar
StdInput, StdOutput, StdError – Standart girdi, çıktı ve hata dosyaları
Environment – Çevre değişkenleri
InputSandbox – Kullanıcı arayüzünden çalışacağı siteye gönderilecek
dosyalar
OutputSandbox – İş bitiminde alınacak dosyalar
Requirements – Gerekli kaynak nitelikleri
Rank – Bulunan kaynakların sıralanması
JDL Nitelikleri (2)
Executable = < string >
• Çalıştırılacak programı göstermektedir.
- Aynı dosya ismi InputSandbox da da belirtilmelidir.
• Özel karakterler izin verilmez.
. (Örnek: Executable = {“/opt/sw/sgdemo/test.sh”}; )
StdOutput, StdError, StdInput = < string >
• Çıktı, hata ve giriş dosyaları
- Aynı dosya isimleri OutputSandbox da da belirtilmelidir.
• Bu nitelik, etkileşimli işler için (interactive jobs) gerekli değildir .
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
10/32
JDL Nitelikleri (3)
InputSandbox, OutputSandbox = < string | string listesi >
• InputSandbox, çalıştırılacak işin ihtiyacı olan giriş dosyaları
- UI (User Interface) den WN (Worker Node)
• OutputSandbox, Sonuç dosyaları
- WN (Worker Node) dan UI (User Interface)
InputSandbox da gösterilen dosyaların toplam boyutu 20 MB
dan az olmalıdır.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
11/32
JDL Nitelikleri (4)
Job Type
• Normal (simple, sequential job), Interactive, MPICH, Checkpointable,
– Checkpointable, Interactive
– Checkppointable, MPI
• MPICH ve NodeNumber
- RB (Resource Broker) uygun CE leri seçmek için kullanır.
Örnek: NodeNumber = 5;
Arguments
• Komut satırı parametreleri vermek için kullanılır.
Örnek:
Executable = “/bin/sh”;
Arguments = “Merhaba Grid Dünyası”;
Environment
• Çevre ayarları listesini. Örnek: Environment = “JAVABIN=/usr/local/java”;)
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
12/32
JDL Nitelikleri (5)
Requirements
• Uygun kaynak koşulları
Örnek:
Requirements=other.GlueCEUniqueID ==
“adc006.cern.ch:2119/jobmanager-pbs-infinite”
Rank
• Requirements niteliğindeki koşullara uygun CE ler
sıralanır.
Örnek:
Rank = other.GlueCEStateFreeCPUs;
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
13/32
JDL Nitelikleri (6)
InputData
• Giriş(input) dosyalarını gösteren (LFN) Logical File Name veya (GUID)
Global Unique Identifier belirtilir.
Örnek: InputData = {“lfn:cmstestfile”,“guid:135b7b23-4a6a-11d7-87e79d101f8c8b70”}; )
DataAccessProtocol
• SE(Storage Element) ulaşmak için kullanılacak Protokol yada
protokoller
Örnek: DataAccessProtocol = {“file”,“gsiftp”};
StorageElement
• Çıkış(output) dosyalarını tutmak için depolama elemanı
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
14/32
JDL Dosyası
ornek.jdl
[
Executable = "/bin/sh";
Arguments = "HelloWorld.sh";
Stdoutput = "stdoutput";
StdError = "stderror";
InputSandbox = {"HelloWorld.c","HelloWorld.sh"};
OutputSandbox = {"stdoutput","stderror"};
Requirements = (other. GlueHostOperatingSystemName == “linux");
Rank = other.GlueCEStateFreeCPUs;
]
İşi göndermeden önce
• JDL dosyasında yer alan niteliklere göre işin çalışabileceği
siteleri görebilirsiniz.
glite-job-list-match <job.jdl>
• İşinizin belli bir sitede çalışması için Requirement satırı
ekliyebilirsiniz.
Requirements = other.GlueCEUniqueID ==
"ce.ulakbim.gov.tr:2119/jobmanager-lcgpbs-sgdemo";
İş Göndermek
glite-job-submit [--vo <VO>] [-o <dosya_ismi>] <job.jdl>
--vo Sanal organizasyon, proxy oluşturulurken tanımlandı ise gerek
yoktur
-o Oluşacak JobID bu dosyaya yazılır
glite-job-status –i <dosya_ismi> (veya jobId)
-i İş gönderilirken verilen dosya ismi burada kullanılabilir
İş Göndermek
glite-job-submit testJob.jdl
**** Warning: UI_VOMS_OVERRIDE ****
The Virtual Organisation name "dteam" you have specified with the UI conf file will be
overriden by the
default VO in your proxy credentials: "sgdemo"
Selected Virtual Organisation name (from proxy certificate extension): sgdemo
Connecting to host wms.ulakbim.gov.tr, port 7772
Logging to host wms.ulakbim.gov.tr, port 9002
*********************************************************************************************
JOB SUBMIT OUTCOME
The job has been successfully submitted to the Network Server.
Use glite-job-status command to check job current status. Your job identifier is:
- https://wms.ulakbim.gov.tr:9000/2n33HIg63quJXLKgHG2m-A JobID
*********************************************************************************************
Diğer İş Komutları
glite-job-cancel <jobid>
Belirtilen işi iptal eder
glite-job-status <jobid>
İş hakkında bilgi verir
glite-job-output <jobid>
İşin çıktı torbasını getirir
glite-job-logging-info <jobid>
İş hakkında detaylı bilgi verir, hata gidermek için yararlı bir komuttur
İş Durumları
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
20/32
•Job State Machine
Submitted – İş UI makinası aracılığı
ile yollandı.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
21/32
Waiting – İş kabul edildi ve WMS
sunucusunda beklemede
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
22/32
Ready
–
İş
WMS
tarafından incelendi ve
uygun CE makinasına
yollanmak için hazır.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
23/32
Scheduled
İş
makinasına
yolladı
kuyrukta bekliyor.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
24/32
CE
ve
Running – İş
çalışmaya başladı
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
25/32
•Job State Machine
Done – İş tamamlandı.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
26/32
Aborted- İş WMS
tarafından iptal edildi.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
27/32
•Job State Machine
Cancelled – İş kullanıcını
isteği üzerine iptal edildi
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
28/32
Cleared- İş için “Çıktı Torbası” UI
makinasına alındı veya zaman
aşımından dolayı silindi.
Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi
29/32

Benzer belgeler

Hands-on: Using a certificate and simple job submission

Hands-on: Using a certificate and simple job submission Oluşturduğunuz geçici sertifikyı yok etmek için:

Detaylı