EK - 4A - Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi

AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ
VE
YAYIN LİSTESİ
1. Adı Soyadı
: Haydar ÖZKAN
İletişim Bilgileri
Adres
: Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi
Telefon
: (0212) 521 81 00
Mail
: [email protected]
2. Doğum - Tarihi
: 1979
3. Unvanı
: Yrd. Doç. Dr.
4. Öğrenim Durumu
: Doktora
5. Yabancı dil
: 91.25 (2008 UDS)
Alan
Üniversite
Yıl
Lisans
Elektrik
Fırat Üniversitesi
1996 - 2000
Bölüm 1.’si
Fakülte 2.’si
Yüksek Lisans
Elektrik
Marmara Üniversitesi
2001 - 2004
Doktora
Elektronik ve Bilgisayar
Bilimleri
Sakarya Üniversitesi
2006 - 2011
Post-doc
Elektrik Mühendisliği
University of California, Los Angeles
ABD
2014 -2015
Derece
6. Akademik Unvanlar:
Derece
Yardımcı Doçent
Üniversite
Alan
Biyomedikal
Mühendisliği
Fatih Sultan Mehmet Vakıf
Üniversitesi
Yıl
2012-
Doçent
Profesör
7. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri :
6.1- Yüksek Lisans Tezleri
Osman Semih Kayhan “Hızlı hastalık teşhis testlerinin bilgisayar tabanlı otomatik okunması
ve hekimlerin e-rapor ile bilgilendirilmesi” İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri
Enstitüsü, 2016 (Eş danışman)
6.2- Doktora Tezleri
8. Yayınlar :
8.1- Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
1. ATES, M., ULUDAG, N., GURKAN, Y.Y., OZKAN, H., MERAL, K., “Supercapacitor
testing
of
Poly(3,6-bis(2,3-dihydrothieno[3,4-b][1,4]dioxin-5-yl)-9-tosyl-9Hcarbazole)/Graphene oxide-Fe3O4 and Modelling” (Submitted)
2. OZKAN, H., TULUM, G., OSMAN, O., ŞAHİN, S., “Automatic detection of pulmonary
embolism in CTA images using machine learning” Elektronika ir Elektrotechnika
(Accepted)
3. OZKAN, H., “A Comparison of Classification Methods for Telediagnosis of
Parkinson’s Disease”, Entropy, 18, 115, 2016. doi:10.3390/e18040115
4. OZKAN, H., and KAYHAN, O.S., “A Novel Automatic Rapid Diagnostic Test Reader
Platform,” Computational and Mathematical Methods in Medicine, vol. 2016, Article ID
7498217, 1-10, 2016. doi:10.1155/2016/7498217
5. ATES, M., KAMER, L., OZKAN, H., “Comparative analysis of poly (N-methylpyrrole)
and its titanium dioxide nanocomposite film formations against equivalent electrical
circuit model for the their corrosion-inhibition effects”, High Performance Polymers, vol.
28, no. 1, 75-84, 2016. doi: 10.1177/0954008315571682
6. BERG, B., CORTAZAR, B., TSENG, D., OZKAN, H., FENG, S., WEI, Q., CHAN, R.,
BURBANO, J., FAROOQUI, Q., LEWINSKI, M., CARLO, D.D., GARNER, O.B., and
OZCAN, A., ”Cellphone-Based Hand-Held Micro-Plate Reader for Point-of-Care Testing
of Enzyme-Linked Immunosorbent Assays”, ACS Nano, 9 (8), pp 7857–7866, 2015. doi:
10.1021/acsnano.5b03203
7. WEI, Q., LUO, W.,HIANG, S., KAPPEL, T., MEJIA, C., TSENG, D., CHAN, R.Y.L.,
YAN, E., QI, H., SHABBIR, F., OZKAN, H., FENG, S and OZCAN A., “Imaging and
Sizing of Single DNA Molecules on a Mobile Phone”, ACS Nano, 8 (12), pp 12725–
12733, 2014. doi: 10.1021/nn505821y
8. OZKAN, H., OSMAN, O., ŞAHİN, S., BOZ, A.F., “A Novel method for pulmonary
embolism detection in CTA images” Computer Methods and Programs in Biomedicine,
113, pp. 757-766, 2014. doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.cmpb.2013.12.014
9. OZKAN, H., “3D Lung vessel segmentation in computed tomography angiography
images” Istanbul University – Journal of Electrical & Electronics Engineering, IUJEEE
Vol. 12(1), 1437-1443, 2012.
8.2- Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceeding) basılan bildiriler.
1. B. Berg, B. Cortazar, D. Tseng, H. Ozkan, S. Feng, Q. Wei, R. Y. Chan, J. Burbano, Q.
Farooqui, M. Lewinski, D. Di Carlo, O. B. Garner, and A. Ozcan, “Cellphone-based
hand-held microplate reader for point-of-care ELISA testing” (Conference Presentation).
Proc. SPIE 9699, Optics and Biophotonics in Low-Resource Settings II, 969905 (May 3,
2016); doi:10.1117/12.2209125.
2. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E.
Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, “Single DNA imaging and
length quantification through a mobile phone microscope” Proc. SPIE 9699, Optics and
Biophotonics in Low-Resource Settings II, 969903 (March 7, 2016);
doi:10.1117/12.2208836.
3. B. Berg, B. Cortazar, D. Tseng, H. Ozkan, S. Feng, Q. Wei, R. Y. Chan, J. Burbano, Q.
Farooqui, M. Lewinski, D. Di Carlo, O. B. Garner, and A. Ozcan, "A Smartphone-based
Microplate Reader for Point-of-Care ELISA Quantification," in Conference on Lasers
and Electro-Optics, OSA Technical Digest (online) (Optical Society of America, 2016),
paper ATu1O.4.
4. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E.
Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, “Field-Portable Smartphone
Microscopy Platform for Wide-field Imaging and Sizing of Single DNA molecules”
CLEO: Applications and Technology, Optical Society of America 2015.
5. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E.
Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, "3D Printed Microscopy on a
Mobile-phone for Imaging and Sizing of Single DNA Molecules," 16th Annual UC
Systemwide Bioengineering Symposium, June 22-24, 2015, University of California,
Santa Cruz, CA, USA
6. A. Feizi, A. Greenbaum, Y. Chan, B. Berg, Y. Zhang, H. Ozkan, P. Chung, M. Wu, and
A. Ozcan, "Portable and Cost-effective Cell Viability Analysis Using Lensfree On-Chip
Imaging," 16th Annual UC Systemwide Bioengineering Symposium, June 22-24, 2015,
University of California, Santa Cruz, CA, USA
7. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, D. Tseng, R. Yan Lok Chan, E. Yan, H.
Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, “Mobile-Phone Based Microscopy for
Imaging and Sizing of Single DNA Molecules,” BMES (Biomedical Engineering
Society) Annual Meeting, (October 7-10, 2015), Tampa, Florida, USA
8. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E. Yan, H. Qi,
F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, "Mobile Phone based Microscopy for
Imaging and Sizing of Single DNA Molecules," ACS National Meeting, March 22-16,
2015, Denver, Colorado, USA
9. H.Ozkan, O. Osman, S. Şahin, “ Computer Aided Detection of Pulmonary Embolism in
Computer Tomography Angiography Images”, IEEE Conference on Electronics,
Computer and Computation (ICECCO’13), 359-362 November 7-8, 2013, Ankara DOI:
http://dx.doi.org/10.1109/ICECCO.2013.6718301
10. H.Ozkan, “Segmental and Subsegmental Lung Vessel Segmentation in CTA Images”,
World Academy of science Engineering end Technology (ICBCBBE 2012), 65, 153155, May 13-14, 2012, Amsterdam.
11. H.Ozkan, “Segmentation of Ascending and Descending Aorta in CTA Images”, World
Academy of science Engineering end Technology (ICBCBBE 2012), 65, 451-453 May
13-14, 2012, Amsterdam.
12. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz., A. Olsun,“Lung
Segmentation Algorithm for CAD System in CTA Images” World Academy of science
Engineering end Technology (ICBCBBE 2011), 77, 306-309, July 24- 26, 2011, Paris
8.3- Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
1.
H. Ozkan, N.F. Serteller, “SCADA Sistemlerinin Eğitim amaçlı kullanılması” 3e
Electrotech dergisi, 10, 102-105 Ekim 2006
8.4- Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan bildiri kitabında basılan bildiriler
1. H. Ozkan, O. S. Kayhan, " Adeno-Rota Virüs Testlerinin Tablet Bilgisayar Aracılığıyla
Sonuçlandırılması" Electric Electronics, Computer Science, Biomedical Engineerings
Meeting (EBBT), Istanbul, Turkey, , pp. 1-3, 2016. doi: 10.1109/EBBT.2016.7483695
2. H. Ozkan, O. S. Kayhan, "Bilgisayar Tabanlı Otomatik Adeno-Rota Virüs Hızlı Hastalık
Teşhis Testlerinin Sonuçlandırılması", 1. Ulusal Biyomedikal Cihaz Tasarımı ve Üretimi
Sempozyumu (UBİCTÜS 2016), Istanbul, Turkiye, 2016.
3. H. Ozkan, T. Ergin, O. Osman, Ö. Dandin, U. Teomete, G Tulum “Travmatik Dalak
Yaralanmalarının Tespitinde Tele-Tıp Uygulaması”, TIPTEKNO 2015, 130-133,
Bodrum, Ekim, 2015.
4. H.Ozkan, G. Tulum, O. Osman, S. Şahin, “Pulmoner Emboli Veri Setinde Özellik
İndirgeme”, TIPTEKNO 2014, 198-201, Kapadokya, Eylül, 2014.
5. H.Ozkan, G. Tulum, O. Osman, S. Şahin, “BTA Görüntülerinde YSA ile Pulmoner
Emboli Tespiti”, TIPTEKNO 2013, 13, 195-198, Antalya, Kasım 2013.
6. H.Ozkan, O. Osman, S. Şahin,” Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde
Pulmoner Emboli Tespiti”, TIPTEKNO 2012, 12, 49-53, Antalya, Kasım 2012.
7. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz. , A. Olsun,
“Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde Akciğer Damarlarının
Bölütlenmesi”, BİYOMUT, TIPTEKNO 2011, 11, 373-377, Antalya, Ekim 2011.
8. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz. , A. Olsun
“Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde Pulmoner Arter, Segment ve
Subsegmentlerin Bölütlenmesi”, TIPTEKNO 2010, 10, 112-117,Antalya, Ekim 2010.
9. Yurtdışı Görevlendirmeler
1. 14-26 Mart 2010 tarihleri arasında İngiltere’nin başkenti Londra’da bulunan University
of Greenwich‘de Erasmus Öğretim Üyesi Hareketliliği kapsamında, araştırma ve
incelemelerde bulunulmuştur.
10. İdari Görevler :
Sıra
1
Görev
Görevin Başlama ve Bitiş tarihi
Biyomedikal Mühendisliği bölüm başkan
yardımcılığı
2015 - Halen
2
3
4
5
11. Ödüller :
TUBİTAK, doktora sonrası araştırma bursu: University of California, Los Angeles, Elektrik
Mühendisliği bölümü, Los Angeles, California, ABD
12. Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeyindeki dersler :
Akademik
yıl
Dönem
Güz
2012-2013
Bahar
Güz
2015-2016
Bahar
Dersin Adı
Lineer Cebir
Lineer Cebir
Matematik II
Devre analizi
Introduction to Biomedical Engineering
Biyomedikal Sinyaller ve Sistemler
Medikal Mühendislik Uygulamaları
Devre analizi
Biomedical signal processing
Sayısal Sistemler
Haftalık Saati
Teorik Uygulama
3
0
3
0
3
2
2
2
2
0
2
1
1
2
2
2
2
2
2
2
Öğrenci
Sayısı
20
47
25
28
26
19
20
25
19
25